Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z331

Krt6b, Keratin, type II cytoskeletal 6B, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt6bQ9Z331 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Krt6bQ9Z331 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Krt6bQ9Z331 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Krt6bQ9Z331 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Krt6bQ9Z331 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Krt6bQ9Z331 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Krt6bQ9Z331 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Krt6bQ9Z331 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Krt6bQ9Z331 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Krt6bQ9Z331 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Krt6bQ9Z331 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Krt6bQ9Z331 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Krt6bQ9Z331 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Krt6bQ9Z331 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Krt6bQ9Z331 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Krt6bQ9Z331 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Krt6bQ9Z331 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Krt6bQ9Z331 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Krt6bQ9Z331 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Krt6bQ9Z331 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Krt6bQ9Z331 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Krt6bQ9Z331 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Krt6bQ9Z331 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt6bQ9Z331 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt6bQ9Z331 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt6bQ9Z331 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt6bQ9Z331 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt6bQ9Z331 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt6bQ9Z331 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt6bQ9Z331 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt6bQ9Z331 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt6bQ9Z331 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt6bQ9Z331 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt6bQ9Z331 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt6bQ9Z331 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt6bQ9Z331 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt6bQ9Z331 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt6bQ9Z331 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt6bQ9Z331 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt6bQ9Z331 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt6bQ9Z331 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt6bQ9Z331 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt6bQ9Z331 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt6bQ9Z331 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt6bQ9Z331 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt6bQ9Z331 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt6bQ9Z331 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt6bQ9Z331 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt6bQ9Z331 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt6bQ9Z331 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt6bQ9Z331 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt6bQ9Z331 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt6bQ9Z331 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt6bQ9Z331 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt6bQ9Z331 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt6bQ9Z331 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt6bQ9Z331 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt6bQ9Z331 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt6bQ9Z331 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt6bQ9Z331 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt6bQ9Z331 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt6bQ9Z331 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt6bQ9Z331 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt6bQ9Z331 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt6bQ9Z331 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt6bQ9Z331 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt6bQ9Z331 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt6bQ9Z331 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt6bQ9Z331 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt6bQ9Z331 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt6bQ9Z331 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt6bQ9Z331 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt6bQ9Z331 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt6bQ9Z331 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt6bQ9Z331 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt6bQ9Z331 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt6bQ9Z331 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt6bQ9Z331 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt6bQ9Z331 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt6bQ9Z331 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt6bQ9Z331 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt6bQ9Z331 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt6bQ9Z331 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt6bQ9Z331 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt6bQ9Z331 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt6bQ9Z331 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt6bQ9Z331 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt6bQ9Z331 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt6bQ9Z331 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt6bQ9Z331 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt6bQ9Z331 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt6bQ9Z331 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt6bQ9Z331 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Krt6bQ9Z331 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Krt6bQ9Z331 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Krt6bQ9Z331 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Krt6bQ9Z331 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Krt6bQ9Z331 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Krt6bQ9Z331 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Krt6bQ9Z331 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms