Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z320

Krt27, Keratin, type I cytoskeletal 27, mousemouse

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Length 448 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt27Q9Z320 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt27Q9Z320 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt27Q9Z320 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt27Q9Z320 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt27Q9Z320 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt27Q9Z320 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt27Q9Z320 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt27Q9Z320 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt27Q9Z320 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt27Q9Z320 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt27Q9Z320 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt27Q9Z320 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt27Q9Z320 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt27Q9Z320 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt27Q9Z320 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt27Q9Z320 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt27Q9Z320 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt27Q9Z320 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt27Q9Z320 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt27Q9Z320 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt27Q9Z320 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt27Q9Z320 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt27Q9Z320 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt27Q9Z320 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt27Q9Z320 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt27Q9Z320 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt27Q9Z320 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt27Q9Z320 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt27Q9Z320 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt27Q9Z320 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt27Q9Z320 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt27Q9Z320 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt27Q9Z320 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt27Q9Z320 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt27Q9Z320 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt27Q9Z320 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt27Q9Z320 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt27Q9Z320 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt27Q9Z320 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt27Q9Z320 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt27Q9Z320 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt27Q9Z320 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt27Q9Z320 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt27Q9Z320 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt27Q9Z320 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt27Q9Z320 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt27Q9Z320 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt27Q9Z320 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt27Q9Z320 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt27Q9Z320 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt27Q9Z320 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt27Q9Z320 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt27Q9Z320 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt27Q9Z320 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt27Q9Z320 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt27Q9Z320 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt27Q9Z320 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt27Q9Z320 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt27Q9Z320 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt27Q9Z320 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt27Q9Z320 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Krt27Q9Z320 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Krt27Q9Z320 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Krt27Q9Z320 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt27Q9Z320 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt27Q9Z320 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt27Q9Z320 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt27Q9Z320 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt27Q9Z320 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt27Q9Z320 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt27Q9Z320 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt27Q9Z320 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt27Q9Z320 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt27Q9Z320 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt27Q9Z320 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt27Q9Z320 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt27Q9Z320 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt27Q9Z320 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt27Q9Z320 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt27Q9Z320 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt27Q9Z320 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt27Q9Z320 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt27Q9Z320 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt27Q9Z320 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt27Q9Z320 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt27Q9Z320 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt27Q9Z320 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt27Q9Z320 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt27Q9Z320 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt27Q9Z320 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt27Q9Z320 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt27Q9Z320 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt27Q9Z320 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt27Q9Z320 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt27Q9Z320 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt27Q9Z320 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt27Q9Z320 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt27Q9Z320 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt27Q9Z320 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt27Q9Z320 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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