Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2J6

Ptgdr2, Prostaglandin D2 receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptgdr2Q9Z2J6 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptgdr2Q9Z2J6 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptgdr2Q9Z2J6 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptgdr2Q9Z2J6 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptgdr2Q9Z2J6 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptgdr2Q9Z2J6 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptgdr2Q9Z2J6 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptgdr2Q9Z2J6 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptgdr2Q9Z2J6 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptgdr2Q9Z2J6 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptgdr2Q9Z2J6 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptgdr2Q9Z2J6 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptgdr2Q9Z2J6 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptgdr2Q9Z2J6 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptgdr2Q9Z2J6 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptgdr2Q9Z2J6 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptgdr2Q9Z2J6 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptgdr2Q9Z2J6 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptgdr2Q9Z2J6 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptgdr2Q9Z2J6 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptgdr2Q9Z2J6 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptgdr2Q9Z2J6 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptgdr2Q9Z2J6 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptgdr2Q9Z2J6 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptgdr2Q9Z2J6 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptgdr2Q9Z2J6 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptgdr2Q9Z2J6 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptgdr2Q9Z2J6 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptgdr2Q9Z2J6 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptgdr2Q9Z2J6 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptgdr2Q9Z2J6 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptgdr2Q9Z2J6 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptgdr2Q9Z2J6 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptgdr2Q9Z2J6 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptgdr2Q9Z2J6 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptgdr2Q9Z2J6 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptgdr2Q9Z2J6 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptgdr2Q9Z2J6 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptgdr2Q9Z2J6 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptgdr2Q9Z2J6 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptgdr2Q9Z2J6 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptgdr2Q9Z2J6 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptgdr2Q9Z2J6 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptgdr2Q9Z2J6 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptgdr2Q9Z2J6 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptgdr2Q9Z2J6 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptgdr2Q9Z2J6 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptgdr2Q9Z2J6 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptgdr2Q9Z2J6 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptgdr2Q9Z2J6 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptgdr2Q9Z2J6 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptgdr2Q9Z2J6 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptgdr2Q9Z2J6 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptgdr2Q9Z2J6 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptgdr2Q9Z2J6 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptgdr2Q9Z2J6 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptgdr2Q9Z2J6 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptgdr2Q9Z2J6 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptgdr2Q9Z2J6 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptgdr2Q9Z2J6 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptgdr2Q9Z2J6 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptgdr2Q9Z2J6 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptgdr2Q9Z2J6 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptgdr2Q9Z2J6 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptgdr2Q9Z2J6 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptgdr2Q9Z2J6 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptgdr2Q9Z2J6 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptgdr2Q9Z2J6 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptgdr2Q9Z2J6 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptgdr2Q9Z2J6 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptgdr2Q9Z2J6 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptgdr2Q9Z2J6 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptgdr2Q9Z2J6 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptgdr2Q9Z2J6 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptgdr2Q9Z2J6 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptgdr2Q9Z2J6 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptgdr2Q9Z2J6 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptgdr2Q9Z2J6 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptgdr2Q9Z2J6 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptgdr2Q9Z2J6 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptgdr2Q9Z2J6 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptgdr2Q9Z2J6 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptgdr2Q9Z2J6 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptgdr2Q9Z2J6 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptgdr2Q9Z2J6 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ptgdr2Q9Z2J6 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ptgdr2Q9Z2J6 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ptgdr2Q9Z2J6 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms