Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E2

Mbd1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd1Q9Z2E2 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mbd1Q9Z2E2 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mbd1Q9Z2E2 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mbd1Q9Z2E2 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mbd1Q9Z2E2 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mbd1Q9Z2E2 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mbd1Q9Z2E2 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mbd1Q9Z2E2 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mbd1Q9Z2E2 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Mbd1Q9Z2E2 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mbd1Q9Z2E2 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mbd1Q9Z2E2 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mbd1Q9Z2E2 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mbd1Q9Z2E2 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mbd1Q9Z2E2 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mbd1Q9Z2E2 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mbd1Q9Z2E2 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mbd1Q9Z2E2 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mbd1Q9Z2E2 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mbd1Q9Z2E2 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mbd1Q9Z2E2 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Mbd1Q9Z2E2 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mbd1Q9Z2E2 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mbd1Q9Z2E2 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mbd1Q9Z2E2 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mbd1Q9Z2E2 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mbd1Q9Z2E2 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mbd1Q9Z2E2 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mbd1Q9Z2E2 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mbd1Q9Z2E2 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mbd1Q9Z2E2 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mbd1Q9Z2E2 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mbd1Q9Z2E2 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mbd1Q9Z2E2 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mbd1Q9Z2E2 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mbd1Q9Z2E2 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mbd1Q9Z2E2 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mbd1Q9Z2E2 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mbd1Q9Z2E2 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mbd1Q9Z2E2 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mbd1Q9Z2E2 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mbd1Q9Z2E2 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mbd1Q9Z2E2 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mbd1Q9Z2E2 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mbd1Q9Z2E2 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mbd1Q9Z2E2 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mbd1Q9Z2E2 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mbd1Q9Z2E2 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mbd1Q9Z2E2 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mbd1Q9Z2E2 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mbd1Q9Z2E2 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mbd1Q9Z2E2 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mbd1Q9Z2E2 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mbd1Q9Z2E2 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mbd1Q9Z2E2 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mbd1Q9Z2E2 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mbd1Q9Z2E2 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mbd1Q9Z2E2 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mbd1Q9Z2E2 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mbd1Q9Z2E2 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mbd1Q9Z2E2 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mbd1Q9Z2E2 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mbd1Q9Z2E2 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mbd1Q9Z2E2 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mbd1Q9Z2E2 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mbd1Q9Z2E2 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Mbd1Q9Z2E2 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mbd1Q9Z2E2 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mbd1Q9Z2E2 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mbd1Q9Z2E2 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mbd1Q9Z2E2 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mbd1Q9Z2E2 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mbd1Q9Z2E2 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mbd1Q9Z2E2 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mbd1Q9Z2E2 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mbd1Q9Z2E2 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mbd1Q9Z2E2 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mbd1Q9Z2E2 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mbd1Q9Z2E2 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mbd1Q9Z2E2 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mbd1Q9Z2E2 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mbd1Q9Z2E2 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mbd1Q9Z2E2 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Mbd1Q9Z2E2 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Mbd1Q9Z2E2 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Mbd1Q9Z2E2 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Mbd1Q9Z2E2 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mbd1Q9Z2E2 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mbd1Q9Z2E2 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mbd1Q9Z2E2 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mbd1Q9Z2E2 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mbd1Q9Z2E2 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mbd1Q9Z2E2 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Mbd1Q9Z2E2 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mbd1Q9Z2E2 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mbd1Q9Z2E2 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Mbd1Q9Z2E2 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mbd1Q9Z2E2 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Mbd1Q9Z2E2 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mbd1Q9Z2E2 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms