Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pdpk1Q9Z2A0 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pdpk1Q9Z2A0 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pdpk1Q9Z2A0 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pdpk1Q9Z2A0 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pdpk1Q9Z2A0 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pdpk1Q9Z2A0 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Pdpk1Q9Z2A0 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pdpk1Q9Z2A0 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pdpk1Q9Z2A0 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pdpk1Q9Z2A0 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pdpk1Q9Z2A0 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pdpk1Q9Z2A0 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pdpk1Q9Z2A0 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pdpk1Q9Z2A0 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pdpk1Q9Z2A0 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pdpk1Q9Z2A0 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pdpk1Q9Z2A0 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pdpk1Q9Z2A0 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pdpk1Q9Z2A0 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pdpk1Q9Z2A0 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pdpk1Q9Z2A0 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pdpk1Q9Z2A0 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pdpk1Q9Z2A0 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pdpk1Q9Z2A0 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Pdpk1Q9Z2A0 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Pdpk1Q9Z2A0 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pdpk1Q9Z2A0 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pdpk1Q9Z2A0 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pdpk1Q9Z2A0 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pdpk1Q9Z2A0 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pdpk1Q9Z2A0 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pdpk1Q9Z2A0 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pdpk1Q9Z2A0 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pdpk1Q9Z2A0 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pdpk1Q9Z2A0 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pdpk1Q9Z2A0 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pdpk1Q9Z2A0 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pdpk1Q9Z2A0 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pdpk1Q9Z2A0 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pdpk1Q9Z2A0 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pdpk1Q9Z2A0 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pdpk1Q9Z2A0 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pdpk1Q9Z2A0 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Pdpk1Q9Z2A0 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pdpk1Q9Z2A0 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Pdpk1Q9Z2A0 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pdpk1Q9Z2A0 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pdpk1Q9Z2A0 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pdpk1Q9Z2A0 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pdpk1Q9Z2A0 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pdpk1Q9Z2A0 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pdpk1Q9Z2A0 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pdpk1Q9Z2A0 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pdpk1Q9Z2A0 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pdpk1Q9Z2A0 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Pdpk1Q9Z2A0 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pdpk1Q9Z2A0 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pdpk1Q9Z2A0 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pdpk1Q9Z2A0 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pdpk1Q9Z2A0 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pdpk1Q9Z2A0 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pdpk1Q9Z2A0 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pdpk1Q9Z2A0 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pdpk1Q9Z2A0 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Pdpk1Q9Z2A0 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pdpk1Q9Z2A0 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdpk1Q9Z2A0 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdpk1Q9Z2A0 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdpk1Q9Z2A0 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdpk1Q9Z2A0 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdpk1Q9Z2A0 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdpk1Q9Z2A0 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdpk1Q9Z2A0 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdpk1Q9Z2A0 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdpk1Q9Z2A0 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdpk1Q9Z2A0 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdpk1Q9Z2A0 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdpk1Q9Z2A0 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdpk1Q9Z2A0 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdpk1Q9Z2A0 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdpk1Q9Z2A0 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdpk1Q9Z2A0 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdpk1Q9Z2A0 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdpk1Q9Z2A0 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdpk1Q9Z2A0 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdpk1Q9Z2A0 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdpk1Q9Z2A0 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdpk1Q9Z2A0 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdpk1Q9Z2A0 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdpk1Q9Z2A0 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdpk1Q9Z2A0 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdpk1Q9Z2A0 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdpk1Q9Z2A0 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdpk1Q9Z2A0 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdpk1Q9Z2A0 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdpk1Q9Z2A0 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdpk1Q9Z2A0 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdpk1Q9Z2A0 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdpk1Q9Z2A0 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms