Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cldn8Q9Z260 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cldn8Q9Z260 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cldn8Q9Z260 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn8Q9Z260 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn8Q9Z260 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn8Q9Z260 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn8Q9Z260 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn8Q9Z260 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn8Q9Z260 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn8Q9Z260 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn8Q9Z260 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn8Q9Z260 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn8Q9Z260 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn8Q9Z260 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn8Q9Z260 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn8Q9Z260 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn8Q9Z260 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn8Q9Z260 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn8Q9Z260 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn8Q9Z260 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn8Q9Z260 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn8Q9Z260 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn8Q9Z260 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn8Q9Z260 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn8Q9Z260 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn8Q9Z260 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn8Q9Z260 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn8Q9Z260 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn8Q9Z260 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn8Q9Z260 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn8Q9Z260 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn8Q9Z260 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn8Q9Z260 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn8Q9Z260 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn8Q9Z260 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn8Q9Z260 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn8Q9Z260 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn8Q9Z260 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn8Q9Z260 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn8Q9Z260 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn8Q9Z260 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn8Q9Z260 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn8Q9Z260 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn8Q9Z260 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn8Q9Z260 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn8Q9Z260 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn8Q9Z260 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn8Q9Z260 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn8Q9Z260 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn8Q9Z260 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn8Q9Z260 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn8Q9Z260 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn8Q9Z260 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn8Q9Z260 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn8Q9Z260 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn8Q9Z260 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn8Q9Z260 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn8Q9Z260 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn8Q9Z260 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn8Q9Z260 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn8Q9Z260 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn8Q9Z260 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn8Q9Z260 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn8Q9Z260 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn8Q9Z260 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn8Q9Z260 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn8Q9Z260 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn8Q9Z260 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn8Q9Z260 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn8Q9Z260 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms