Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ilf3Q9Z1X4 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ilf3Q9Z1X4 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ilf3Q9Z1X4 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ilf3Q9Z1X4 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms