Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N5

Ddx39b, Spliceosome RNA helicase Ddx39b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx39bQ9Z1N5 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ddx39bQ9Z1N5 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ddx39bQ9Z1N5 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ddx39bQ9Z1N5 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ddx39bQ9Z1N5 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ddx39bQ9Z1N5 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ddx39bQ9Z1N5 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ddx39bQ9Z1N5 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ddx39bQ9Z1N5 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ddx39bQ9Z1N5 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ddx39bQ9Z1N5 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ddx39bQ9Z1N5 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ddx39bQ9Z1N5 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ddx39bQ9Z1N5 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ddx39bQ9Z1N5 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ddx39bQ9Z1N5 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ddx39bQ9Z1N5 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ddx39bQ9Z1N5 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ddx39bQ9Z1N5 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ddx39bQ9Z1N5 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ddx39bQ9Z1N5 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ddx39bQ9Z1N5 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ddx39bQ9Z1N5 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ddx39bQ9Z1N5 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ddx39bQ9Z1N5 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ddx39bQ9Z1N5 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ddx39bQ9Z1N5 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ddx39bQ9Z1N5 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ddx39bQ9Z1N5 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ddx39bQ9Z1N5 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ddx39bQ9Z1N5 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ddx39bQ9Z1N5 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ddx39bQ9Z1N5 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ddx39bQ9Z1N5 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ddx39bQ9Z1N5 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ddx39bQ9Z1N5 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ddx39bQ9Z1N5 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ddx39bQ9Z1N5 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ddx39bQ9Z1N5 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ddx39bQ9Z1N5 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ddx39bQ9Z1N5 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ddx39bQ9Z1N5 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ddx39bQ9Z1N5 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ddx39bQ9Z1N5 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ddx39bQ9Z1N5 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ddx39bQ9Z1N5 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ddx39bQ9Z1N5 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ddx39bQ9Z1N5 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ddx39bQ9Z1N5 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ddx39bQ9Z1N5 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ddx39bQ9Z1N5 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ddx39bQ9Z1N5 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ddx39bQ9Z1N5 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ddx39bQ9Z1N5 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ddx39bQ9Z1N5 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ddx39bQ9Z1N5 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ddx39bQ9Z1N5 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ddx39bQ9Z1N5 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ddx39bQ9Z1N5 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ddx39bQ9Z1N5 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ddx39bQ9Z1N5 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ddx39bQ9Z1N5 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ddx39bQ9Z1N5 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ddx39bQ9Z1N5 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ddx39bQ9Z1N5 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ddx39bQ9Z1N5 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ddx39bQ9Z1N5 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ddx39bQ9Z1N5 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ddx39bQ9Z1N5 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ddx39bQ9Z1N5 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ddx39bQ9Z1N5 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ddx39bQ9Z1N5 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ddx39bQ9Z1N5 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ddx39bQ9Z1N5 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ddx39bQ9Z1N5 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ddx39bQ9Z1N5 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ddx39bQ9Z1N5 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ddx39bQ9Z1N5 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ddx39bQ9Z1N5 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ddx39bQ9Z1N5 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ddx39bQ9Z1N5 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ddx39bQ9Z1N5 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ddx39bQ9Z1N5 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ddx39bQ9Z1N5 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ddx39bQ9Z1N5 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ddx39bQ9Z1N5 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ddx39bQ9Z1N5 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ddx39bQ9Z1N5 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ddx39bQ9Z1N5 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ddx39bQ9Z1N5 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ddx39bQ9Z1N5 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ddx39bQ9Z1N5 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ddx39bQ9Z1N5 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ddx39bQ9Z1N5 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ddx39bQ9Z1N5 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ddx39bQ9Z1N5 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ddx39bQ9Z1N5 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ddx39bQ9Z1N5 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ddx39bQ9Z1N5 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ddx39bQ9Z1N5 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms