Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1J3

Nfs1, Cysteine desulfurase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfs1Q9Z1J3 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nfs1Q9Z1J3 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Nfs1Q9Z1J3 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nfs1Q9Z1J3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nfs1Q9Z1J3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nfs1Q9Z1J3 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nfs1Q9Z1J3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nfs1Q9Z1J3 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nfs1Q9Z1J3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nfs1Q9Z1J3 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nfs1Q9Z1J3 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nfs1Q9Z1J3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nfs1Q9Z1J3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nfs1Q9Z1J3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nfs1Q9Z1J3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Nfs1Q9Z1J3 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nfs1Q9Z1J3 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nfs1Q9Z1J3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nfs1Q9Z1J3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nfs1Q9Z1J3 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nfs1Q9Z1J3 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nfs1Q9Z1J3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nfs1Q9Z1J3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nfs1Q9Z1J3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nfs1Q9Z1J3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nfs1Q9Z1J3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nfs1Q9Z1J3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nfs1Q9Z1J3 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Nfs1Q9Z1J3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Nfs1Q9Z1J3 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nfs1Q9Z1J3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nfs1Q9Z1J3 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nfs1Q9Z1J3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nfs1Q9Z1J3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nfs1Q9Z1J3 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nfs1Q9Z1J3 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nfs1Q9Z1J3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Nfs1Q9Z1J3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nfs1Q9Z1J3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nfs1Q9Z1J3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nfs1Q9Z1J3 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nfs1Q9Z1J3 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nfs1Q9Z1J3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nfs1Q9Z1J3 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nfs1Q9Z1J3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nfs1Q9Z1J3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nfs1Q9Z1J3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nfs1Q9Z1J3 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nfs1Q9Z1J3 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nfs1Q9Z1J3 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nfs1Q9Z1J3 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Nfs1Q9Z1J3 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nfs1Q9Z1J3 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nfs1Q9Z1J3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nfs1Q9Z1J3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nfs1Q9Z1J3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nfs1Q9Z1J3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nfs1Q9Z1J3 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nfs1Q9Z1J3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nfs1Q9Z1J3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nfs1Q9Z1J3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nfs1Q9Z1J3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nfs1Q9Z1J3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nfs1Q9Z1J3 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nfs1Q9Z1J3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nfs1Q9Z1J3 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nfs1Q9Z1J3 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nfs1Q9Z1J3 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nfs1Q9Z1J3 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nfs1Q9Z1J3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nfs1Q9Z1J3 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nfs1Q9Z1J3 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nfs1Q9Z1J3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nfs1Q9Z1J3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nfs1Q9Z1J3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nfs1Q9Z1J3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nfs1Q9Z1J3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nfs1Q9Z1J3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nfs1Q9Z1J3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nfs1Q9Z1J3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nfs1Q9Z1J3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nfs1Q9Z1J3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nfs1Q9Z1J3 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Nfs1Q9Z1J3 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nfs1Q9Z1J3 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nfs1Q9Z1J3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nfs1Q9Z1J3 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nfs1Q9Z1J3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nfs1Q9Z1J3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nfs1Q9Z1J3 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Nfs1Q9Z1J3 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nfs1Q9Z1J3 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nfs1Q9Z1J3 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nfs1Q9Z1J3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nfs1Q9Z1J3 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nfs1Q9Z1J3 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nfs1Q9Z1J3 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nfs1Q9Z1J3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nfs1Q9Z1J3 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nfs1Q9Z1J3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms