Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1J2

Nek4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, mousemouse

Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek4Q9Z1J2 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nek4Q9Z1J2 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nek4Q9Z1J2 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nek4Q9Z1J2 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nek4Q9Z1J2 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nek4Q9Z1J2 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nek4Q9Z1J2 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nek4Q9Z1J2 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nek4Q9Z1J2 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Nek4Q9Z1J2 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Nek4Q9Z1J2 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Nek4Q9Z1J2 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Nek4Q9Z1J2 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nek4Q9Z1J2 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nek4Q9Z1J2 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nek4Q9Z1J2 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nek4Q9Z1J2 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nek4Q9Z1J2 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nek4Q9Z1J2 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nek4Q9Z1J2 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nek4Q9Z1J2 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nek4Q9Z1J2 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nek4Q9Z1J2 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nek4Q9Z1J2 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Nek4Q9Z1J2 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nek4Q9Z1J2 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Nek4Q9Z1J2 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nek4Q9Z1J2 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nek4Q9Z1J2 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Nek4Q9Z1J2 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nek4Q9Z1J2 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nek4Q9Z1J2 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nek4Q9Z1J2 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nek4Q9Z1J2 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nek4Q9Z1J2 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nek4Q9Z1J2 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nek4Q9Z1J2 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nek4Q9Z1J2 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nek4Q9Z1J2 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nek4Q9Z1J2 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nek4Q9Z1J2 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nek4Q9Z1J2 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nek4Q9Z1J2 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nek4Q9Z1J2 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Nek4Q9Z1J2 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nek4Q9Z1J2 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nek4Q9Z1J2 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nek4Q9Z1J2 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nek4Q9Z1J2 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nek4Q9Z1J2 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nek4Q9Z1J2 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nek4Q9Z1J2 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nek4Q9Z1J2 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nek4Q9Z1J2 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nek4Q9Z1J2 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nek4Q9Z1J2 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nek4Q9Z1J2 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nek4Q9Z1J2 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nek4Q9Z1J2 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nek4Q9Z1J2 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nek4Q9Z1J2 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nek4Q9Z1J2 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nek4Q9Z1J2 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nek4Q9Z1J2 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nek4Q9Z1J2 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nek4Q9Z1J2 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nek4Q9Z1J2 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nek4Q9Z1J2 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nek4Q9Z1J2 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nek4Q9Z1J2 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nek4Q9Z1J2 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nek4Q9Z1J2 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nek4Q9Z1J2 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nek4Q9Z1J2 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nek4Q9Z1J2 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nek4Q9Z1J2 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nek4Q9Z1J2 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nek4Q9Z1J2 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nek4Q9Z1J2 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nek4Q9Z1J2 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nek4Q9Z1J2 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nek4Q9Z1J2 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nek4Q9Z1J2 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nek4Q9Z1J2 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nek4Q9Z1J2 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nek4Q9Z1J2 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nek4Q9Z1J2 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nek4Q9Z1J2 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Nek4Q9Z1J2 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nek4Q9Z1J2 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nek4Q9Z1J2 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nek4Q9Z1J2 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nek4Q9Z1J2 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nek4Q9Z1J2 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nek4Q9Z1J2 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nek4Q9Z1J2 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nek4Q9Z1J2 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Nek4Q9Z1J2 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nek4Q9Z1J2 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nek4Q9Z1J2 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms