Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z185

Padi1, Protein-arginine deiminase type-1, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Padi1Q9Z185 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Padi1Q9Z185 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Padi1Q9Z185 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Padi1Q9Z185 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Padi1Q9Z185 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Padi1Q9Z185 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Padi1Q9Z185 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Padi1Q9Z185 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Padi1Q9Z185 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Padi1Q9Z185 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Padi1Q9Z185 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Padi1Q9Z185 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Padi1Q9Z185 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Padi1Q9Z185 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Padi1Q9Z185 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Padi1Q9Z185 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Padi1Q9Z185 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Padi1Q9Z185 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Padi1Q9Z185 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Padi1Q9Z185 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Padi1Q9Z185 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Padi1Q9Z185 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Padi1Q9Z185 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Padi1Q9Z185 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Padi1Q9Z185 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Padi1Q9Z185 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Padi1Q9Z185 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Padi1Q9Z185 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Padi1Q9Z185 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Padi1Q9Z185 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Padi1Q9Z185 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Padi1Q9Z185 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Padi1Q9Z185 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Padi1Q9Z185 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Padi1Q9Z185 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Padi1Q9Z185 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Padi1Q9Z185 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Padi1Q9Z185 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Padi1Q9Z185 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Padi1Q9Z185 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Padi1Q9Z185 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Padi1Q9Z185 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Padi1Q9Z185 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Padi1Q9Z185 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Padi1Q9Z185 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Padi1Q9Z185 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Padi1Q9Z185 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Padi1Q9Z185 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Padi1Q9Z185 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Padi1Q9Z185 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Padi1Q9Z185 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Padi1Q9Z185 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Padi1Q9Z185 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Padi1Q9Z185 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Padi1Q9Z185 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Padi1Q9Z185 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Padi1Q9Z185 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Padi1Q9Z185 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Padi1Q9Z185 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Padi1Q9Z185 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Padi1Q9Z185 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Padi1Q9Z185 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Padi1Q9Z185 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Padi1Q9Z185 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Padi1Q9Z185 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Padi1Q9Z185 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Padi1Q9Z185 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Padi1Q9Z185 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Padi1Q9Z185 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Padi1Q9Z185 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Padi1Q9Z185 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Padi1Q9Z185 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Padi1Q9Z185 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Padi1Q9Z185 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Padi1Q9Z185 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Padi1Q9Z185 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Padi1Q9Z185 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Padi1Q9Z185 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Padi1Q9Z185 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Padi1Q9Z185 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Padi1Q9Z185 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Padi1Q9Z185 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Padi1Q9Z185 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Padi1Q9Z185 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Padi1Q9Z185 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Padi1Q9Z185 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Padi1Q9Z185 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Padi1Q9Z185 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Padi1Q9Z185 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Padi1Q9Z185 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Padi1Q9Z185 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Padi1Q9Z185 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Padi1Q9Z185 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Padi1Q9Z185 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Padi1Q9Z185 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Padi1Q9Z185 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Padi1Q9Z185 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Padi1Q9Z185 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Padi1Q9Z185 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Padi1Q9Z185 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms