Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z184

Padi3, Protein-arginine deiminase type-3, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Padi3Q9Z184 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Padi3Q9Z184 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Padi3Q9Z184 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Padi3Q9Z184 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Padi3Q9Z184 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Padi3Q9Z184 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Padi3Q9Z184 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Padi3Q9Z184 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Padi3Q9Z184 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Padi3Q9Z184 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Padi3Q9Z184 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Padi3Q9Z184 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Padi3Q9Z184 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Padi3Q9Z184 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Padi3Q9Z184 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Padi3Q9Z184 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Padi3Q9Z184 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Padi3Q9Z184 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Padi3Q9Z184 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Padi3Q9Z184 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Padi3Q9Z184 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Padi3Q9Z184 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Padi3Q9Z184 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Padi3Q9Z184 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Padi3Q9Z184 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Padi3Q9Z184 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Padi3Q9Z184 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Padi3Q9Z184 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Padi3Q9Z184 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Padi3Q9Z184 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Padi3Q9Z184 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Padi3Q9Z184 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Padi3Q9Z184 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Padi3Q9Z184 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Padi3Q9Z184 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Padi3Q9Z184 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Padi3Q9Z184 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Padi3Q9Z184 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Padi3Q9Z184 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Padi3Q9Z184 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Padi3Q9Z184 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Padi3Q9Z184 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Padi3Q9Z184 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Padi3Q9Z184 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Padi3Q9Z184 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Padi3Q9Z184 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Padi3Q9Z184 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Padi3Q9Z184 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Padi3Q9Z184 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Padi3Q9Z184 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Padi3Q9Z184 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Padi3Q9Z184 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Padi3Q9Z184 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Padi3Q9Z184 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Padi3Q9Z184 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Padi3Q9Z184 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Padi3Q9Z184 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Padi3Q9Z184 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Padi3Q9Z184 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Padi3Q9Z184 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Padi3Q9Z184 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Padi3Q9Z184 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Padi3Q9Z184 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Padi3Q9Z184 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Padi3Q9Z184 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Padi3Q9Z184 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Padi3Q9Z184 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Padi3Q9Z184 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Padi3Q9Z184 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Padi3Q9Z184 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Padi3Q9Z184 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Padi3Q9Z184 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Padi3Q9Z184 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Padi3Q9Z184 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Padi3Q9Z184 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Padi3Q9Z184 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Padi3Q9Z184 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Padi3Q9Z184 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Padi3Q9Z184 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Padi3Q9Z184 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Padi3Q9Z184 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Padi3Q9Z184 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Padi3Q9Z184 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Padi3Q9Z184 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Padi3Q9Z184 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Padi3Q9Z184 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Padi3Q9Z184 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Padi3Q9Z184 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Padi3Q9Z184 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Padi3Q9Z184 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Padi3Q9Z184 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Padi3Q9Z184 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Padi3Q9Z184 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Padi3Q9Z184 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Padi3Q9Z184 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Padi3Q9Z184 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Padi3Q9Z184 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Padi3Q9Z184 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Padi3Q9Z184 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Padi3Q9Z184 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms