Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z180

Setbp1, SET-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setbp1Q9Z180 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Setbp1Q9Z180 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Setbp1Q9Z180 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Setbp1Q9Z180 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Setbp1Q9Z180 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Setbp1Q9Z180 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Setbp1Q9Z180 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Setbp1Q9Z180 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Setbp1Q9Z180 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Setbp1Q9Z180 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Setbp1Q9Z180 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Setbp1Q9Z180 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Setbp1Q9Z180 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Setbp1Q9Z180 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Setbp1Q9Z180 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Setbp1Q9Z180 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Setbp1Q9Z180 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Setbp1Q9Z180 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Setbp1Q9Z180 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Setbp1Q9Z180 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Setbp1Q9Z180 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Setbp1Q9Z180 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Setbp1Q9Z180 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Setbp1Q9Z180 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Setbp1Q9Z180 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Setbp1Q9Z180 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Setbp1Q9Z180 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Setbp1Q9Z180 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Setbp1Q9Z180 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Setbp1Q9Z180 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Setbp1Q9Z180 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Setbp1Q9Z180 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Setbp1Q9Z180 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Setbp1Q9Z180 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Setbp1Q9Z180 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Setbp1Q9Z180 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Setbp1Q9Z180 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Setbp1Q9Z180 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Setbp1Q9Z180 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Setbp1Q9Z180 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Setbp1Q9Z180 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Setbp1Q9Z180 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Setbp1Q9Z180 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Setbp1Q9Z180 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Setbp1Q9Z180 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Setbp1Q9Z180 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Setbp1Q9Z180 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Setbp1Q9Z180 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Setbp1Q9Z180 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Setbp1Q9Z180 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Setbp1Q9Z180 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Setbp1Q9Z180 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Setbp1Q9Z180 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Setbp1Q9Z180 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Setbp1Q9Z180 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Setbp1Q9Z180 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Setbp1Q9Z180 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Setbp1Q9Z180 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Setbp1Q9Z180 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Setbp1Q9Z180 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Setbp1Q9Z180 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Setbp1Q9Z180 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Setbp1Q9Z180 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Setbp1Q9Z180 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Setbp1Q9Z180 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Setbp1Q9Z180 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Setbp1Q9Z180 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Setbp1Q9Z180 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Setbp1Q9Z180 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Setbp1Q9Z180 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Setbp1Q9Z180 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Setbp1Q9Z180 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Setbp1Q9Z180 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Setbp1Q9Z180 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Setbp1Q9Z180 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Setbp1Q9Z180 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Setbp1Q9Z180 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Setbp1Q9Z180 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Setbp1Q9Z180 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Setbp1Q9Z180 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Setbp1Q9Z180 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Setbp1Q9Z180 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Setbp1Q9Z180 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Setbp1Q9Z180 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Setbp1Q9Z180 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Setbp1Q9Z180 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Setbp1Q9Z180 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Setbp1Q9Z180 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Setbp1Q9Z180 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Setbp1Q9Z180 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Setbp1Q9Z180 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Setbp1Q9Z180 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Setbp1Q9Z180 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Setbp1Q9Z180 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Setbp1Q9Z180 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Setbp1Q9Z180 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Setbp1Q9Z180 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Setbp1Q9Z180 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Setbp1Q9Z180 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Setbp1Q9Z180 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms