Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z131

Sh3bp5, SH3 domain-binding protein 5, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5Q9Z131 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sh3bp5Q9Z131 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sh3bp5Q9Z131 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Sh3bp5Q9Z131 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Sh3bp5Q9Z131 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Sh3bp5Q9Z131 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Sh3bp5Q9Z131 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sh3bp5Q9Z131 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
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Sh3bp5Q9Z131 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
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Sh3bp5Q9Z131 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sh3bp5Q9Z131 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sh3bp5Q9Z131 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sh3bp5Q9Z131 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sh3bp5Q9Z131 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
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Sh3bp5Q9Z131 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sh3bp5Q9Z131 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sh3bp5Q9Z131 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sh3bp5Q9Z131 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sh3bp5Q9Z131 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
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Sh3bp5Q9Z131 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
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Sh3bp5Q9Z131 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
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Sh3bp5Q9Z131 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sh3bp5Q9Z131 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sh3bp5Q9Z131 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sh3bp5Q9Z131 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
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Sh3bp5Q9Z131 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
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Sh3bp5Q9Z131 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sh3bp5Q9Z131 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sh3bp5Q9Z131 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sh3bp5Q9Z131 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sh3bp5Q9Z131 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sh3bp5Q9Z131 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sh3bp5Q9Z131 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sh3bp5Q9Z131 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
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Sh3bp5Q9Z131 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
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Sh3bp5Q9Z131 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Sh3bp5Q9Z131 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sh3bp5Q9Z131 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sh3bp5Q9Z131 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
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Sh3bp5Q9Z131 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sh3bp5Q9Z131 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sh3bp5Q9Z131 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sh3bp5Q9Z131 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sh3bp5Q9Z131 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
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Sh3bp5Q9Z131 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sh3bp5Q9Z131 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sh3bp5Q9Z131 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sh3bp5Q9Z131 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sh3bp5Q9Z131 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sh3bp5Q9Z131 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sh3bp5Q9Z131 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sh3bp5Q9Z131 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sh3bp5Q9Z131 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Sh3bp5Q9Z131 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sh3bp5Q9Z131 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Sh3bp5Q9Z131 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sh3bp5Q9Z131 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
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