Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z123

Sema4f, Semaphorin-4F, mousemouse

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4fQ9Z123 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sema4fQ9Z123 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sema4fQ9Z123 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sema4fQ9Z123 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sema4fQ9Z123 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sema4fQ9Z123 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sema4fQ9Z123 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sema4fQ9Z123 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sema4fQ9Z123 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sema4fQ9Z123 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sema4fQ9Z123 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sema4fQ9Z123 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sema4fQ9Z123 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sema4fQ9Z123 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sema4fQ9Z123 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sema4fQ9Z123 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sema4fQ9Z123 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sema4fQ9Z123 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sema4fQ9Z123 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sema4fQ9Z123 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sema4fQ9Z123 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sema4fQ9Z123 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sema4fQ9Z123 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sema4fQ9Z123 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sema4fQ9Z123 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sema4fQ9Z123 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sema4fQ9Z123 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sema4fQ9Z123 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sema4fQ9Z123 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sema4fQ9Z123 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sema4fQ9Z123 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sema4fQ9Z123 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sema4fQ9Z123 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sema4fQ9Z123 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sema4fQ9Z123 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sema4fQ9Z123 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sema4fQ9Z123 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sema4fQ9Z123 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sema4fQ9Z123 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sema4fQ9Z123 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sema4fQ9Z123 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sema4fQ9Z123 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sema4fQ9Z123 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sema4fQ9Z123 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sema4fQ9Z123 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sema4fQ9Z123 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sema4fQ9Z123 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sema4fQ9Z123 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sema4fQ9Z123 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Sema4fQ9Z123 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sema4fQ9Z123 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sema4fQ9Z123 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sema4fQ9Z123 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sema4fQ9Z123 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sema4fQ9Z123 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sema4fQ9Z123 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sema4fQ9Z123 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sema4fQ9Z123 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sema4fQ9Z123 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sema4fQ9Z123 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sema4fQ9Z123 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sema4fQ9Z123 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sema4fQ9Z123 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sema4fQ9Z123 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Sema4fQ9Z123 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sema4fQ9Z123 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sema4fQ9Z123 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sema4fQ9Z123 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sema4fQ9Z123 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sema4fQ9Z123 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sema4fQ9Z123 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sema4fQ9Z123 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Sema4fQ9Z123 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sema4fQ9Z123 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sema4fQ9Z123 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sema4fQ9Z123 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sema4fQ9Z123 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sema4fQ9Z123 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sema4fQ9Z123 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sema4fQ9Z123 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sema4fQ9Z123 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sema4fQ9Z123 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sema4fQ9Z123 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sema4fQ9Z123 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sema4fQ9Z123 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sema4fQ9Z123 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sema4fQ9Z123 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sema4fQ9Z123 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sema4fQ9Z123 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sema4fQ9Z123 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sema4fQ9Z123 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sema4fQ9Z123 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sema4fQ9Z123 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sema4fQ9Z123 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sema4fQ9Z123 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Sema4fQ9Z123 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sema4fQ9Z123 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Sema4fQ9Z123 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sema4fQ9Z123 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sema4fQ9Z123 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms