Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W1

Ngfr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgfrQ9Z0W1 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NgfrQ9Z0W1 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NgfrQ9Z0W1 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NgfrQ9Z0W1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NgfrQ9Z0W1 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NgfrQ9Z0W1 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NgfrQ9Z0W1 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NgfrQ9Z0W1 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NgfrQ9Z0W1 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NgfrQ9Z0W1 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NgfrQ9Z0W1 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NgfrQ9Z0W1 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NgfrQ9Z0W1 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NgfrQ9Z0W1 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NgfrQ9Z0W1 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NgfrQ9Z0W1 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NgfrQ9Z0W1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NgfrQ9Z0W1 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NgfrQ9Z0W1 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NgfrQ9Z0W1 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NgfrQ9Z0W1 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NgfrQ9Z0W1 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NgfrQ9Z0W1 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NgfrQ9Z0W1 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NgfrQ9Z0W1 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NgfrQ9Z0W1 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NgfrQ9Z0W1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NgfrQ9Z0W1 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NgfrQ9Z0W1 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NgfrQ9Z0W1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NgfrQ9Z0W1 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NgfrQ9Z0W1 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NgfrQ9Z0W1 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NgfrQ9Z0W1 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NgfrQ9Z0W1 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NgfrQ9Z0W1 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NgfrQ9Z0W1 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NgfrQ9Z0W1 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NgfrQ9Z0W1 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NgfrQ9Z0W1 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NgfrQ9Z0W1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NgfrQ9Z0W1 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NgfrQ9Z0W1 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NgfrQ9Z0W1 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NgfrQ9Z0W1 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NgfrQ9Z0W1 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NgfrQ9Z0W1 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NgfrQ9Z0W1 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NgfrQ9Z0W1 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NgfrQ9Z0W1 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NgfrQ9Z0W1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NgfrQ9Z0W1 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NgfrQ9Z0W1 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NgfrQ9Z0W1 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NgfrQ9Z0W1 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NgfrQ9Z0W1 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NgfrQ9Z0W1 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NgfrQ9Z0W1 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NgfrQ9Z0W1 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NgfrQ9Z0W1 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NgfrQ9Z0W1 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NgfrQ9Z0W1 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NgfrQ9Z0W1 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NgfrQ9Z0W1 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NgfrQ9Z0W1 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NgfrQ9Z0W1 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NgfrQ9Z0W1 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NgfrQ9Z0W1 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NgfrQ9Z0W1 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NgfrQ9Z0W1 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NgfrQ9Z0W1 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NgfrQ9Z0W1 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NgfrQ9Z0W1 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms