Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E6

Gbp2, Guanylate-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp2Q9Z0E6 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gbp2Q9Z0E6 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gbp2Q9Z0E6 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gbp2Q9Z0E6 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gbp2Q9Z0E6 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gbp2Q9Z0E6 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gbp2Q9Z0E6 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gbp2Q9Z0E6 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gbp2Q9Z0E6 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gbp2Q9Z0E6 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gbp2Q9Z0E6 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gbp2Q9Z0E6 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gbp2Q9Z0E6 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Gbp2Q9Z0E6 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Gbp2Q9Z0E6 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gbp2Q9Z0E6 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gbp2Q9Z0E6 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gbp2Q9Z0E6 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gbp2Q9Z0E6 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gbp2Q9Z0E6 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gbp2Q9Z0E6 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gbp2Q9Z0E6 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gbp2Q9Z0E6 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gbp2Q9Z0E6 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gbp2Q9Z0E6 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gbp2Q9Z0E6 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gbp2Q9Z0E6 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gbp2Q9Z0E6 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gbp2Q9Z0E6 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gbp2Q9Z0E6 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gbp2Q9Z0E6 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gbp2Q9Z0E6 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gbp2Q9Z0E6 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gbp2Q9Z0E6 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gbp2Q9Z0E6 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Gbp2Q9Z0E6 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gbp2Q9Z0E6 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Gbp2Q9Z0E6 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gbp2Q9Z0E6 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gbp2Q9Z0E6 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Gbp2Q9Z0E6 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gbp2Q9Z0E6 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gbp2Q9Z0E6 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gbp2Q9Z0E6 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gbp2Q9Z0E6 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gbp2Q9Z0E6 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gbp2Q9Z0E6 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gbp2Q9Z0E6 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gbp2Q9Z0E6 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gbp2Q9Z0E6 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gbp2Q9Z0E6 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gbp2Q9Z0E6 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gbp2Q9Z0E6 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gbp2Q9Z0E6 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gbp2Q9Z0E6 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gbp2Q9Z0E6 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gbp2Q9Z0E6 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gbp2Q9Z0E6 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gbp2Q9Z0E6 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gbp2Q9Z0E6 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gbp2Q9Z0E6 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gbp2Q9Z0E6 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gbp2Q9Z0E6 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gbp2Q9Z0E6 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gbp2Q9Z0E6 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gbp2Q9Z0E6 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Gbp2Q9Z0E6 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gbp2Q9Z0E6 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gbp2Q9Z0E6 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbp2Q9Z0E6 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbp2Q9Z0E6 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbp2Q9Z0E6 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbp2Q9Z0E6 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbp2Q9Z0E6 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbp2Q9Z0E6 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbp2Q9Z0E6 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbp2Q9Z0E6 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbp2Q9Z0E6 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbp2Q9Z0E6 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbp2Q9Z0E6 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbp2Q9Z0E6 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbp2Q9Z0E6 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbp2Q9Z0E6 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbp2Q9Z0E6 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbp2Q9Z0E6 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbp2Q9Z0E6 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbp2Q9Z0E6 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gbp2Q9Z0E6 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gbp2Q9Z0E6 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gbp2Q9Z0E6 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gbp2Q9Z0E6 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gbp2Q9Z0E6 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gbp2Q9Z0E6 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gbp2Q9Z0E6 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gbp2Q9Z0E6 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gbp2Q9Z0E6 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gbp2Q9Z0E6 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gbp2Q9Z0E6 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gbp2Q9Z0E6 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gbp2Q9Z0E6 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms