Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV35

Apobec2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec2Q9WV35 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apobec2Q9WV35 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apobec2Q9WV35 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apobec2Q9WV35 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apobec2Q9WV35 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apobec2Q9WV35 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apobec2Q9WV35 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apobec2Q9WV35 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apobec2Q9WV35 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apobec2Q9WV35 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apobec2Q9WV35 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apobec2Q9WV35 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apobec2Q9WV35 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apobec2Q9WV35 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apobec2Q9WV35 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apobec2Q9WV35 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apobec2Q9WV35 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apobec2Q9WV35 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apobec2Q9WV35 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apobec2Q9WV35 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apobec2Q9WV35 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apobec2Q9WV35 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apobec2Q9WV35 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apobec2Q9WV35 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apobec2Q9WV35 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apobec2Q9WV35 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apobec2Q9WV35 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apobec2Q9WV35 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Apobec2Q9WV35 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apobec2Q9WV35 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apobec2Q9WV35 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apobec2Q9WV35 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apobec2Q9WV35 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apobec2Q9WV35 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apobec2Q9WV35 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apobec2Q9WV35 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apobec2Q9WV35 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Apobec2Q9WV35 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apobec2Q9WV35 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Apobec2Q9WV35 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Apobec2Q9WV35 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apobec2Q9WV35 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apobec2Q9WV35 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apobec2Q9WV35 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apobec2Q9WV35 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apobec2Q9WV35 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apobec2Q9WV35 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apobec2Q9WV35 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Apobec2Q9WV35 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apobec2Q9WV35 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apobec2Q9WV35 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apobec2Q9WV35 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apobec2Q9WV35 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apobec2Q9WV35 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apobec2Q9WV35 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apobec2Q9WV35 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apobec2Q9WV35 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apobec2Q9WV35 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apobec2Q9WV35 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Apobec2Q9WV35 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apobec2Q9WV35 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apobec2Q9WV35 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apobec2Q9WV35 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apobec2Q9WV35 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apobec2Q9WV35 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apobec2Q9WV35 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apobec2Q9WV35 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apobec2Q9WV35 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Apobec2Q9WV35 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Apobec2Q9WV35 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Apobec2Q9WV35 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apobec2Q9WV35 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apobec2Q9WV35 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apobec2Q9WV35 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apobec2Q9WV35 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apobec2Q9WV35 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apobec2Q9WV35 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apobec2Q9WV35 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apobec2Q9WV35 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apobec2Q9WV35 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apobec2Q9WV35 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apobec2Q9WV35 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Apobec2Q9WV35 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apobec2Q9WV35 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apobec2Q9WV35 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Apobec2Q9WV35 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apobec2Q9WV35 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apobec2Q9WV35 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apobec2Q9WV35 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apobec2Q9WV35 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apobec2Q9WV35 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apobec2Q9WV35 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apobec2Q9WV35 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apobec2Q9WV35 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apobec2Q9WV35 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apobec2Q9WV35 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apobec2Q9WV35 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apobec2Q9WV35 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apobec2Q9WV35 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apobec2Q9WV35 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms