Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUD1

Stub1, STIP1 homology and U box-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stub1Q9WUD1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stub1Q9WUD1 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stub1Q9WUD1 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stub1Q9WUD1 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stub1Q9WUD1 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stub1Q9WUD1 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Stub1Q9WUD1 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Stub1Q9WUD1 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Stub1Q9WUD1 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Stub1Q9WUD1 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Stub1Q9WUD1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Stub1Q9WUD1 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Stub1Q9WUD1 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Stub1Q9WUD1 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Stub1Q9WUD1 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Stub1Q9WUD1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stub1Q9WUD1 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stub1Q9WUD1 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stub1Q9WUD1 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stub1Q9WUD1 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stub1Q9WUD1 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stub1Q9WUD1 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stub1Q9WUD1 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stub1Q9WUD1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stub1Q9WUD1 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stub1Q9WUD1 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stub1Q9WUD1 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stub1Q9WUD1 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stub1Q9WUD1 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stub1Q9WUD1 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stub1Q9WUD1 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stub1Q9WUD1 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stub1Q9WUD1 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stub1Q9WUD1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stub1Q9WUD1 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stub1Q9WUD1 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stub1Q9WUD1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stub1Q9WUD1 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stub1Q9WUD1 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stub1Q9WUD1 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stub1Q9WUD1 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Stub1Q9WUD1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stub1Q9WUD1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stub1Q9WUD1 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stub1Q9WUD1 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stub1Q9WUD1 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stub1Q9WUD1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stub1Q9WUD1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stub1Q9WUD1 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stub1Q9WUD1 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stub1Q9WUD1 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Stub1Q9WUD1 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stub1Q9WUD1 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stub1Q9WUD1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stub1Q9WUD1 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stub1Q9WUD1 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stub1Q9WUD1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stub1Q9WUD1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stub1Q9WUD1 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stub1Q9WUD1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stub1Q9WUD1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Stub1Q9WUD1 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Stub1Q9WUD1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stub1Q9WUD1 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stub1Q9WUD1 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stub1Q9WUD1 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stub1Q9WUD1 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Stub1Q9WUD1 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stub1Q9WUD1 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Stub1Q9WUD1 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stub1Q9WUD1 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stub1Q9WUD1 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stub1Q9WUD1 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stub1Q9WUD1 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stub1Q9WUD1 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Stub1Q9WUD1 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stub1Q9WUD1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stub1Q9WUD1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stub1Q9WUD1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stub1Q9WUD1 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stub1Q9WUD1 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stub1Q9WUD1 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stub1Q9WUD1 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stub1Q9WUD1 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stub1Q9WUD1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stub1Q9WUD1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stub1Q9WUD1 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stub1Q9WUD1 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stub1Q9WUD1 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stub1Q9WUD1 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stub1Q9WUD1 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stub1Q9WUD1 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stub1Q9WUD1 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stub1Q9WUD1 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stub1Q9WUD1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stub1Q9WUD1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stub1Q9WUD1 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stub1Q9WUD1 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stub1Q9WUD1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stub1Q9WUD1 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms