Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU56

Pus1, tRNA pseudouridine synthase A, mousemouse

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Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus1Q9WU56 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Pus1Q9WU56 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pus1Q9WU56 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pus1Q9WU56 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pus1Q9WU56 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pus1Q9WU56 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pus1Q9WU56 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pus1Q9WU56 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Pus1Q9WU56 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pus1Q9WU56 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Pus1Q9WU56 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pus1Q9WU56 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pus1Q9WU56 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pus1Q9WU56 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pus1Q9WU56 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pus1Q9WU56 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Pus1Q9WU56 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pus1Q9WU56 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pus1Q9WU56 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pus1Q9WU56 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pus1Q9WU56 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pus1Q9WU56 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pus1Q9WU56 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pus1Q9WU56 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pus1Q9WU56 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pus1Q9WU56 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pus1Q9WU56 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pus1Q9WU56 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pus1Q9WU56 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pus1Q9WU56 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pus1Q9WU56 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Pus1Q9WU56 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pus1Q9WU56 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pus1Q9WU56 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pus1Q9WU56 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pus1Q9WU56 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pus1Q9WU56 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pus1Q9WU56 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pus1Q9WU56 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pus1Q9WU56 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pus1Q9WU56 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pus1Q9WU56 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pus1Q9WU56 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pus1Q9WU56 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pus1Q9WU56 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pus1Q9WU56 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pus1Q9WU56 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pus1Q9WU56 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Pus1Q9WU56 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pus1Q9WU56 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pus1Q9WU56 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pus1Q9WU56 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pus1Q9WU56 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pus1Q9WU56 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pus1Q9WU56 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pus1Q9WU56 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pus1Q9WU56 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Pus1Q9WU56 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pus1Q9WU56 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pus1Q9WU56 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Pus1Q9WU56 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Pus1Q9WU56 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Pus1Q9WU56 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Pus1Q9WU56 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pus1Q9WU56 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pus1Q9WU56 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pus1Q9WU56 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Pus1Q9WU56 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pus1Q9WU56 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pus1Q9WU56 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pus1Q9WU56 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pus1Q9WU56 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pus1Q9WU56 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pus1Q9WU56 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pus1Q9WU56 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pus1Q9WU56 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pus1Q9WU56 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pus1Q9WU56 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pus1Q9WU56 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pus1Q9WU56 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pus1Q9WU56 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pus1Q9WU56 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pus1Q9WU56 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pus1Q9WU56 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pus1Q9WU56 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pus1Q9WU56 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pus1Q9WU56 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pus1Q9WU56 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pus1Q9WU56 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pus1Q9WU56 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pus1Q9WU56 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pus1Q9WU56 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms