Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTV6

Usp18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp18Q9WTV6 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp18Q9WTV6 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp18Q9WTV6 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp18Q9WTV6 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp18Q9WTV6 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp18Q9WTV6 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp18Q9WTV6 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp18Q9WTV6 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp18Q9WTV6 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp18Q9WTV6 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp18Q9WTV6 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp18Q9WTV6 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp18Q9WTV6 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp18Q9WTV6 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp18Q9WTV6 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp18Q9WTV6 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp18Q9WTV6 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp18Q9WTV6 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp18Q9WTV6 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp18Q9WTV6 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp18Q9WTV6 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp18Q9WTV6 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp18Q9WTV6 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Usp18Q9WTV6 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Usp18Q9WTV6 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Usp18Q9WTV6 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Usp18Q9WTV6 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp18Q9WTV6 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp18Q9WTV6 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp18Q9WTV6 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp18Q9WTV6 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp18Q9WTV6 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp18Q9WTV6 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp18Q9WTV6 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp18Q9WTV6 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp18Q9WTV6 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp18Q9WTV6 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp18Q9WTV6 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp18Q9WTV6 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp18Q9WTV6 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp18Q9WTV6 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp18Q9WTV6 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp18Q9WTV6 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp18Q9WTV6 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp18Q9WTV6 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp18Q9WTV6 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp18Q9WTV6 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp18Q9WTV6 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp18Q9WTV6 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp18Q9WTV6 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp18Q9WTV6 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp18Q9WTV6 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp18Q9WTV6 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp18Q9WTV6 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp18Q9WTV6 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp18Q9WTV6 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp18Q9WTV6 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp18Q9WTV6 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp18Q9WTV6 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp18Q9WTV6 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp18Q9WTV6 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp18Q9WTV6 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp18Q9WTV6 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp18Q9WTV6 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp18Q9WTV6 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp18Q9WTV6 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp18Q9WTV6 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp18Q9WTV6 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp18Q9WTV6 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp18Q9WTV6 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp18Q9WTV6 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp18Q9WTV6 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp18Q9WTV6 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp18Q9WTV6 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp18Q9WTV6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp18Q9WTV6 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp18Q9WTV6 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp18Q9WTV6 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp18Q9WTV6 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp18Q9WTV6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp18Q9WTV6 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp18Q9WTV6 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp18Q9WTV6 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp18Q9WTV6 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp18Q9WTV6 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp18Q9WTV6 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp18Q9WTV6 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp18Q9WTV6 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp18Q9WTV6 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp18Q9WTV6 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp18Q9WTV6 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp18Q9WTV6 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp18Q9WTV6 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp18Q9WTV6 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp18Q9WTV6 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp18Q9WTV6 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp18Q9WTV6 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp18Q9WTV6 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp18Q9WTV6 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp18Q9WTV6 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms