Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTJ8

Fam50b, Protein FAM50B, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam50bQ9WTJ8 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam50bQ9WTJ8 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam50bQ9WTJ8 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam50bQ9WTJ8 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam50bQ9WTJ8 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam50bQ9WTJ8 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam50bQ9WTJ8 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam50bQ9WTJ8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam50bQ9WTJ8 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam50bQ9WTJ8 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam50bQ9WTJ8 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam50bQ9WTJ8 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam50bQ9WTJ8 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam50bQ9WTJ8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam50bQ9WTJ8 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam50bQ9WTJ8 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam50bQ9WTJ8 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam50bQ9WTJ8 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fam50bQ9WTJ8 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fam50bQ9WTJ8 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fam50bQ9WTJ8 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Fam50bQ9WTJ8 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fam50bQ9WTJ8 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fam50bQ9WTJ8 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fam50bQ9WTJ8 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fam50bQ9WTJ8 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fam50bQ9WTJ8 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fam50bQ9WTJ8 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fam50bQ9WTJ8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam50bQ9WTJ8 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam50bQ9WTJ8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam50bQ9WTJ8 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam50bQ9WTJ8 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam50bQ9WTJ8 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam50bQ9WTJ8 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam50bQ9WTJ8 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam50bQ9WTJ8 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam50bQ9WTJ8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam50bQ9WTJ8 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam50bQ9WTJ8 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam50bQ9WTJ8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam50bQ9WTJ8 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam50bQ9WTJ8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fam50bQ9WTJ8 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fam50bQ9WTJ8 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fam50bQ9WTJ8 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fam50bQ9WTJ8 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fam50bQ9WTJ8 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fam50bQ9WTJ8 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Fam50bQ9WTJ8 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fam50bQ9WTJ8 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fam50bQ9WTJ8 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fam50bQ9WTJ8 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fam50bQ9WTJ8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fam50bQ9WTJ8 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fam50bQ9WTJ8 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fam50bQ9WTJ8 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fam50bQ9WTJ8 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fam50bQ9WTJ8 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Fam50bQ9WTJ8 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fam50bQ9WTJ8 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Fam50bQ9WTJ8 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fam50bQ9WTJ8 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fam50bQ9WTJ8 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fam50bQ9WTJ8 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fam50bQ9WTJ8 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Fam50bQ9WTJ8 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Fam50bQ9WTJ8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Fam50bQ9WTJ8 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fam50bQ9WTJ8 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fam50bQ9WTJ8 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fam50bQ9WTJ8 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fam50bQ9WTJ8 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fam50bQ9WTJ8 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fam50bQ9WTJ8 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Fam50bQ9WTJ8 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fam50bQ9WTJ8 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fam50bQ9WTJ8 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fam50bQ9WTJ8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fam50bQ9WTJ8 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Fam50bQ9WTJ8 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fam50bQ9WTJ8 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fam50bQ9WTJ8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fam50bQ9WTJ8 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fam50bQ9WTJ8 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fam50bQ9WTJ8 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fam50bQ9WTJ8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fam50bQ9WTJ8 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fam50bQ9WTJ8 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fam50bQ9WTJ8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fam50bQ9WTJ8 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fam50bQ9WTJ8 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fam50bQ9WTJ8 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fam50bQ9WTJ8 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Fam50bQ9WTJ8 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fam50bQ9WTJ8 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fam50bQ9WTJ8 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fam50bQ9WTJ8 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fam50bQ9WTJ8 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fam50bQ9WTJ8 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms