Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1C0

Taf7, Transcription initiation factor TFIID subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf7Q9R1C0 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Taf7Q9R1C0 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Taf7Q9R1C0 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Taf7Q9R1C0 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Taf7Q9R1C0 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Taf7Q9R1C0 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Taf7Q9R1C0 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Taf7Q9R1C0 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Taf7Q9R1C0 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Taf7Q9R1C0 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Taf7Q9R1C0 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Taf7Q9R1C0 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Taf7Q9R1C0 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Taf7Q9R1C0 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Taf7Q9R1C0 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Taf7Q9R1C0 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Taf7Q9R1C0 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Taf7Q9R1C0 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Taf7Q9R1C0 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Taf7Q9R1C0 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Taf7Q9R1C0 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Taf7Q9R1C0 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Taf7Q9R1C0 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Taf7Q9R1C0 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Taf7Q9R1C0 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Taf7Q9R1C0 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Taf7Q9R1C0 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Taf7Q9R1C0 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Taf7Q9R1C0 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Taf7Q9R1C0 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Taf7Q9R1C0 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Taf7Q9R1C0 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Taf7Q9R1C0 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Taf7Q9R1C0 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Taf7Q9R1C0 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Taf7Q9R1C0 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Taf7Q9R1C0 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Taf7Q9R1C0 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Taf7Q9R1C0 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Taf7Q9R1C0 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Taf7Q9R1C0 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Taf7Q9R1C0 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Taf7Q9R1C0 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Taf7Q9R1C0 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Taf7Q9R1C0 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Taf7Q9R1C0 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Taf7Q9R1C0 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Taf7Q9R1C0 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Taf7Q9R1C0 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Taf7Q9R1C0 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Taf7Q9R1C0 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Taf7Q9R1C0 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Taf7Q9R1C0 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Taf7Q9R1C0 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Taf7Q9R1C0 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Taf7Q9R1C0 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Taf7Q9R1C0 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Taf7Q9R1C0 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Taf7Q9R1C0 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Taf7Q9R1C0 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Taf7Q9R1C0 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Taf7Q9R1C0 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Taf7Q9R1C0 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Taf7Q9R1C0 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Taf7Q9R1C0 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Taf7Q9R1C0 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Taf7Q9R1C0 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Taf7Q9R1C0 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Taf7Q9R1C0 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Taf7Q9R1C0 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Taf7Q9R1C0 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Taf7Q9R1C0 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Taf7Q9R1C0 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Taf7Q9R1C0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Taf7Q9R1C0 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Taf7Q9R1C0 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Taf7Q9R1C0 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Taf7Q9R1C0 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Taf7Q9R1C0 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Taf7Q9R1C0 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Taf7Q9R1C0 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Taf7Q9R1C0 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Taf7Q9R1C0 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Taf7Q9R1C0 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Taf7Q9R1C0 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Taf7Q9R1C0 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Taf7Q9R1C0 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Taf7Q9R1C0 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Taf7Q9R1C0 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Taf7Q9R1C0 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Taf7Q9R1C0 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Taf7Q9R1C0 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Taf7Q9R1C0 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Taf7Q9R1C0 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Taf7Q9R1C0 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Taf7Q9R1C0 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Taf7Q9R1C0 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Taf7Q9R1C0 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Taf7Q9R1C0 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Taf7Q9R1C0 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms