Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q3

Tmed2, Transmembrane emp24 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed2Q9R0Q3 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmed2Q9R0Q3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmed2Q9R0Q3 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmed2Q9R0Q3 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmed2Q9R0Q3 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmed2Q9R0Q3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmed2Q9R0Q3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmed2Q9R0Q3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmed2Q9R0Q3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmed2Q9R0Q3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmed2Q9R0Q3 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmed2Q9R0Q3 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmed2Q9R0Q3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmed2Q9R0Q3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmed2Q9R0Q3 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmed2Q9R0Q3 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmed2Q9R0Q3 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmed2Q9R0Q3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmed2Q9R0Q3 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmed2Q9R0Q3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmed2Q9R0Q3 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmed2Q9R0Q3 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmed2Q9R0Q3 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmed2Q9R0Q3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmed2Q9R0Q3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmed2Q9R0Q3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmed2Q9R0Q3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmed2Q9R0Q3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmed2Q9R0Q3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmed2Q9R0Q3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmed2Q9R0Q3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmed2Q9R0Q3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmed2Q9R0Q3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmed2Q9R0Q3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmed2Q9R0Q3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmed2Q9R0Q3 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmed2Q9R0Q3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmed2Q9R0Q3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmed2Q9R0Q3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmed2Q9R0Q3 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmed2Q9R0Q3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmed2Q9R0Q3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmed2Q9R0Q3 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmed2Q9R0Q3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmed2Q9R0Q3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmed2Q9R0Q3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmed2Q9R0Q3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmed2Q9R0Q3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmed2Q9R0Q3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmed2Q9R0Q3 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmed2Q9R0Q3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmed2Q9R0Q3 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmed2Q9R0Q3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmed2Q9R0Q3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmed2Q9R0Q3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmed2Q9R0Q3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmed2Q9R0Q3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmed2Q9R0Q3 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmed2Q9R0Q3 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmed2Q9R0Q3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmed2Q9R0Q3 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmed2Q9R0Q3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmed2Q9R0Q3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmed2Q9R0Q3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmed2Q9R0Q3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmed2Q9R0Q3 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmed2Q9R0Q3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmed2Q9R0Q3 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmed2Q9R0Q3 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmed2Q9R0Q3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmed2Q9R0Q3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmed2Q9R0Q3 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tmed2Q9R0Q3 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tmed2Q9R0Q3 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tmed2Q9R0Q3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tmed2Q9R0Q3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmed2Q9R0Q3 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmed2Q9R0Q3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmed2Q9R0Q3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmed2Q9R0Q3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmed2Q9R0Q3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmed2Q9R0Q3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmed2Q9R0Q3 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmed2Q9R0Q3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmed2Q9R0Q3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmed2Q9R0Q3 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmed2Q9R0Q3 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmed2Q9R0Q3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmed2Q9R0Q3 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmed2Q9R0Q3 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmed2Q9R0Q3 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmed2Q9R0Q3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmed2Q9R0Q3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmed2Q9R0Q3 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmed2Q9R0Q3 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmed2Q9R0Q3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmed2Q9R0Q3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmed2Q9R0Q3 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmed2Q9R0Q3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmed2Q9R0Q3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms