Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS8

Sh2d3c, SH2 domain-containing protein 3C, mousemouse

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d3cQ9QZS8 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh2d3cQ9QZS8 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh2d3cQ9QZS8 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh2d3cQ9QZS8 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh2d3cQ9QZS8 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh2d3cQ9QZS8 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh2d3cQ9QZS8 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh2d3cQ9QZS8 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh2d3cQ9QZS8 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh2d3cQ9QZS8 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh2d3cQ9QZS8 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh2d3cQ9QZS8 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh2d3cQ9QZS8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh2d3cQ9QZS8 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh2d3cQ9QZS8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh2d3cQ9QZS8 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh2d3cQ9QZS8 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh2d3cQ9QZS8 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh2d3cQ9QZS8 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh2d3cQ9QZS8 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh2d3cQ9QZS8 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh2d3cQ9QZS8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh2d3cQ9QZS8 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh2d3cQ9QZS8 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh2d3cQ9QZS8 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh2d3cQ9QZS8 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh2d3cQ9QZS8 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh2d3cQ9QZS8 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh2d3cQ9QZS8 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh2d3cQ9QZS8 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh2d3cQ9QZS8 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh2d3cQ9QZS8 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh2d3cQ9QZS8 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh2d3cQ9QZS8 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh2d3cQ9QZS8 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh2d3cQ9QZS8 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh2d3cQ9QZS8 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh2d3cQ9QZS8 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh2d3cQ9QZS8 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh2d3cQ9QZS8 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh2d3cQ9QZS8 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh2d3cQ9QZS8 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh2d3cQ9QZS8 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh2d3cQ9QZS8 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh2d3cQ9QZS8 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh2d3cQ9QZS8 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh2d3cQ9QZS8 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh2d3cQ9QZS8 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh2d3cQ9QZS8 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh2d3cQ9QZS8 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh2d3cQ9QZS8 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh2d3cQ9QZS8 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh2d3cQ9QZS8 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh2d3cQ9QZS8 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh2d3cQ9QZS8 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh2d3cQ9QZS8 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh2d3cQ9QZS8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh2d3cQ9QZS8 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh2d3cQ9QZS8 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh2d3cQ9QZS8 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh2d3cQ9QZS8 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh2d3cQ9QZS8 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh2d3cQ9QZS8 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh2d3cQ9QZS8 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh2d3cQ9QZS8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh2d3cQ9QZS8 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh2d3cQ9QZS8 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh2d3cQ9QZS8 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh2d3cQ9QZS8 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh2d3cQ9QZS8 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh2d3cQ9QZS8 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh2d3cQ9QZS8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh2d3cQ9QZS8 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh2d3cQ9QZS8 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh2d3cQ9QZS8 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh2d3cQ9QZS8 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh2d3cQ9QZS8 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh2d3cQ9QZS8 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh2d3cQ9QZS8 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh2d3cQ9QZS8 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh2d3cQ9QZS8 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh2d3cQ9QZS8 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh2d3cQ9QZS8 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh2d3cQ9QZS8 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh2d3cQ9QZS8 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh2d3cQ9QZS8 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh2d3cQ9QZS8 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh2d3cQ9QZS8 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh2d3cQ9QZS8 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh2d3cQ9QZS8 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh2d3cQ9QZS8 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh2d3cQ9QZS8 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sh2d3cQ9QZS8 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sh2d3cQ9QZS8 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sh2d3cQ9QZS8 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sh2d3cQ9QZS8 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sh2d3cQ9QZS8 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sh2d3cQ9QZS8 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sh2d3cQ9QZS8 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sh2d3cQ9QZS8 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms