Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM3

Clcf1, Cardiotrophin-like cytokine factor 1, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcf1Q9QZM3 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clcf1Q9QZM3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clcf1Q9QZM3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clcf1Q9QZM3 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Clcf1Q9QZM3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Clcf1Q9QZM3 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Clcf1Q9QZM3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Clcf1Q9QZM3 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Clcf1Q9QZM3 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Clcf1Q9QZM3 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Clcf1Q9QZM3 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clcf1Q9QZM3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clcf1Q9QZM3 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clcf1Q9QZM3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clcf1Q9QZM3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clcf1Q9QZM3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clcf1Q9QZM3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clcf1Q9QZM3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clcf1Q9QZM3 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clcf1Q9QZM3 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clcf1Q9QZM3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clcf1Q9QZM3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clcf1Q9QZM3 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clcf1Q9QZM3 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clcf1Q9QZM3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clcf1Q9QZM3 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clcf1Q9QZM3 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clcf1Q9QZM3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clcf1Q9QZM3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clcf1Q9QZM3 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clcf1Q9QZM3 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Clcf1Q9QZM3 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clcf1Q9QZM3 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Clcf1Q9QZM3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clcf1Q9QZM3 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clcf1Q9QZM3 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clcf1Q9QZM3 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clcf1Q9QZM3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clcf1Q9QZM3 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clcf1Q9QZM3 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clcf1Q9QZM3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clcf1Q9QZM3 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clcf1Q9QZM3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clcf1Q9QZM3 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Clcf1Q9QZM3 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clcf1Q9QZM3 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clcf1Q9QZM3 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clcf1Q9QZM3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clcf1Q9QZM3 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Clcf1Q9QZM3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clcf1Q9QZM3 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clcf1Q9QZM3 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clcf1Q9QZM3 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clcf1Q9QZM3 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clcf1Q9QZM3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clcf1Q9QZM3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clcf1Q9QZM3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clcf1Q9QZM3 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clcf1Q9QZM3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clcf1Q9QZM3 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clcf1Q9QZM3 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clcf1Q9QZM3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clcf1Q9QZM3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clcf1Q9QZM3 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Clcf1Q9QZM3 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clcf1Q9QZM3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clcf1Q9QZM3 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Clcf1Q9QZM3 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clcf1Q9QZM3 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Clcf1Q9QZM3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clcf1Q9QZM3 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clcf1Q9QZM3 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clcf1Q9QZM3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clcf1Q9QZM3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clcf1Q9QZM3 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clcf1Q9QZM3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clcf1Q9QZM3 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clcf1Q9QZM3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clcf1Q9QZM3 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clcf1Q9QZM3 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clcf1Q9QZM3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clcf1Q9QZM3 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clcf1Q9QZM3 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clcf1Q9QZM3 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clcf1Q9QZM3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clcf1Q9QZM3 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clcf1Q9QZM3 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clcf1Q9QZM3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Clcf1Q9QZM3 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clcf1Q9QZM3 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clcf1Q9QZM3 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clcf1Q9QZM3 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clcf1Q9QZM3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clcf1Q9QZM3 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clcf1Q9QZM3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clcf1Q9QZM3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clcf1Q9QZM3 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clcf1Q9QZM3 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clcf1Q9QZM3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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