Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZE5

Copg1, Coatomer subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg1Q9QZE5 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Copg1Q9QZE5 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Copg1Q9QZE5 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Copg1Q9QZE5 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Copg1Q9QZE5 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Copg1Q9QZE5 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Copg1Q9QZE5 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Copg1Q9QZE5 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Copg1Q9QZE5 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Copg1Q9QZE5 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Copg1Q9QZE5 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Copg1Q9QZE5 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Copg1Q9QZE5 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Copg1Q9QZE5 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Copg1Q9QZE5 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Copg1Q9QZE5 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Copg1Q9QZE5 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Copg1Q9QZE5 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Copg1Q9QZE5 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Copg1Q9QZE5 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Copg1Q9QZE5 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Copg1Q9QZE5 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Copg1Q9QZE5 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Copg1Q9QZE5 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Copg1Q9QZE5 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Copg1Q9QZE5 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Copg1Q9QZE5 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Copg1Q9QZE5 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Copg1Q9QZE5 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Copg1Q9QZE5 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Copg1Q9QZE5 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Copg1Q9QZE5 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Copg1Q9QZE5 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Copg1Q9QZE5 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Copg1Q9QZE5 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Copg1Q9QZE5 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Copg1Q9QZE5 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Copg1Q9QZE5 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Copg1Q9QZE5 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Copg1Q9QZE5 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Copg1Q9QZE5 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Copg1Q9QZE5 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Copg1Q9QZE5 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Copg1Q9QZE5 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Copg1Q9QZE5 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Copg1Q9QZE5 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Copg1Q9QZE5 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Copg1Q9QZE5 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Copg1Q9QZE5 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Copg1Q9QZE5 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Copg1Q9QZE5 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Copg1Q9QZE5 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Copg1Q9QZE5 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Copg1Q9QZE5 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Copg1Q9QZE5 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Copg1Q9QZE5 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Copg1Q9QZE5 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Copg1Q9QZE5 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Copg1Q9QZE5 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Copg1Q9QZE5 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Copg1Q9QZE5 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Copg1Q9QZE5 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Copg1Q9QZE5 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Copg1Q9QZE5 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Copg1Q9QZE5 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Copg1Q9QZE5 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Copg1Q9QZE5 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Copg1Q9QZE5 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Copg1Q9QZE5 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Copg1Q9QZE5 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Copg1Q9QZE5 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Copg1Q9QZE5 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Copg1Q9QZE5 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Copg1Q9QZE5 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Copg1Q9QZE5 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Copg1Q9QZE5 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Copg1Q9QZE5 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Copg1Q9QZE5 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Copg1Q9QZE5 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Copg1Q9QZE5 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Copg1Q9QZE5 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Copg1Q9QZE5 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Copg1Q9QZE5 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Copg1Q9QZE5 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Copg1Q9QZE5 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Copg1Q9QZE5 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Copg1Q9QZE5 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Copg1Q9QZE5 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Copg1Q9QZE5 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Copg1Q9QZE5 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Copg1Q9QZE5 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Copg1Q9QZE5 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Copg1Q9QZE5 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Copg1Q9QZE5 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Copg1Q9QZE5 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Copg1Q9QZE5 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Copg1Q9QZE5 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Copg1Q9QZE5 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Copg1Q9QZE5 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Copg1Q9QZE5 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms