Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ercc4Q9QZD4 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ercc4Q9QZD4 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ercc4Q9QZD4 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ercc4Q9QZD4 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ercc4Q9QZD4 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ercc4Q9QZD4 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ercc4Q9QZD4 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ercc4Q9QZD4 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ercc4Q9QZD4 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ercc4Q9QZD4 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ercc4Q9QZD4 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ercc4Q9QZD4 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ercc4Q9QZD4 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ercc4Q9QZD4 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ercc4Q9QZD4 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ercc4Q9QZD4 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ercc4Q9QZD4 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ercc4Q9QZD4 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ercc4Q9QZD4 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ercc4Q9QZD4 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ercc4Q9QZD4 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ercc4Q9QZD4 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ercc4Q9QZD4 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ercc4Q9QZD4 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ercc4Q9QZD4 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ercc4Q9QZD4 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ercc4Q9QZD4 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ercc4Q9QZD4 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ercc4Q9QZD4 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ercc4Q9QZD4 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ercc4Q9QZD4 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ercc4Q9QZD4 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ercc4Q9QZD4 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ercc4Q9QZD4 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ercc4Q9QZD4 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ercc4Q9QZD4 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ercc4Q9QZD4 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ercc4Q9QZD4 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ercc4Q9QZD4 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ercc4Q9QZD4 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ercc4Q9QZD4 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ercc4Q9QZD4 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ercc4Q9QZD4 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ercc4Q9QZD4 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ercc4Q9QZD4 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ercc4Q9QZD4 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ercc4Q9QZD4 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ercc4Q9QZD4 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ercc4Q9QZD4 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ercc4Q9QZD4 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ercc4Q9QZD4 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ercc4Q9QZD4 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ercc4Q9QZD4 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ercc4Q9QZD4 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ercc4Q9QZD4 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ercc4Q9QZD4 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ercc4Q9QZD4 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ercc4Q9QZD4 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ercc4Q9QZD4 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ercc4Q9QZD4 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ercc4Q9QZD4 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ercc4Q9QZD4 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ercc4Q9QZD4 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ercc4Q9QZD4 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ercc4Q9QZD4 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ercc4Q9QZD4 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ercc4Q9QZD4 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ercc4Q9QZD4 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ercc4Q9QZD4 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ercc4Q9QZD4 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ercc4Q9QZD4 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ercc4Q9QZD4 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ercc4Q9QZD4 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ercc4Q9QZD4 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ercc4Q9QZD4 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ercc4Q9QZD4 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ercc4Q9QZD4 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ercc4Q9QZD4 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ercc4Q9QZD4 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ercc4Q9QZD4 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ercc4Q9QZD4 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ercc4Q9QZD4 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ercc4Q9QZD4 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ercc4Q9QZD4 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ercc4Q9QZD4 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ercc4Q9QZD4 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ercc4Q9QZD4 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ercc4Q9QZD4 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ercc4Q9QZD4 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ercc4Q9QZD4 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ercc4Q9QZD4 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ercc4Q9QZD4 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ercc4Q9QZD4 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ercc4Q9QZD4 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ercc4Q9QZD4 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ercc4Q9QZD4 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ercc4Q9QZD4 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ercc4Q9QZD4 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ercc4Q9QZD4 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms