Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ubxn8Q9QZ49 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ubxn8Q9QZ49 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ubxn8Q9QZ49 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ubxn8Q9QZ49 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ubxn8Q9QZ49 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ubxn8Q9QZ49 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ubxn8Q9QZ49 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ubxn8Q9QZ49 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ubxn8Q9QZ49 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ubxn8Q9QZ49 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ubxn8Q9QZ49 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ubxn8Q9QZ49 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ubxn8Q9QZ49 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ubxn8Q9QZ49 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ubxn8Q9QZ49 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ubxn8Q9QZ49 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ubxn8Q9QZ49 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ubxn8Q9QZ49 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ubxn8Q9QZ49 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ubxn8Q9QZ49 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ubxn8Q9QZ49 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ubxn8Q9QZ49 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Ubxn8Q9QZ49 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ubxn8Q9QZ49 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ubxn8Q9QZ49 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ubxn8Q9QZ49 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ubxn8Q9QZ49 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ubxn8Q9QZ49 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ubxn8Q9QZ49 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ubxn8Q9QZ49 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ubxn8Q9QZ49 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Ubxn8Q9QZ49 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ubxn8Q9QZ49 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ubxn8Q9QZ49 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Ubxn8Q9QZ49 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Ubxn8Q9QZ49 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ubxn8Q9QZ49 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ubxn8Q9QZ49 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ubxn8Q9QZ49 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ubxn8Q9QZ49 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ubxn8Q9QZ49 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ubxn8Q9QZ49 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ubxn8Q9QZ49 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ubxn8Q9QZ49 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ubxn8Q9QZ49 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Ubxn8Q9QZ49 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ubxn8Q9QZ49 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ubxn8Q9QZ49 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ubxn8Q9QZ49 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ubxn8Q9QZ49 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ubxn8Q9QZ49 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ubxn8Q9QZ49 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ubxn8Q9QZ49 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ubxn8Q9QZ49 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ubxn8Q9QZ49 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ubxn8Q9QZ49 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Ubxn8Q9QZ49 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ubxn8Q9QZ49 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ubxn8Q9QZ49 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ubxn8Q9QZ49 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ubxn8Q9QZ49 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ubxn8Q9QZ49 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ubxn8Q9QZ49 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ubxn8Q9QZ49 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ubxn8Q9QZ49 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ubxn8Q9QZ49 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ubxn8Q9QZ49 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ubxn8Q9QZ49 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Ubxn8Q9QZ49 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ubxn8Q9QZ49 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ubxn8Q9QZ49 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ubxn8Q9QZ49 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ubxn8Q9QZ49 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ubxn8Q9QZ49 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ubxn8Q9QZ49 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Ubxn8Q9QZ49 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ubxn8Q9QZ49 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ubxn8Q9QZ49 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ubxn8Q9QZ49 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ubxn8Q9QZ49 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ubxn8Q9QZ49 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ubxn8Q9QZ49 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Ubxn8Q9QZ49 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Ubxn8Q9QZ49 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Ubxn8Q9QZ49 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Ubxn8Q9QZ49 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ubxn8Q9QZ49 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ubxn8Q9QZ49 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ubxn8Q9QZ49 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ubxn8Q9QZ49 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ubxn8Q9QZ49 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ubxn8Q9QZ49 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Ubxn8Q9QZ49 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ubxn8Q9QZ49 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ubxn8Q9QZ49 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ubxn8Q9QZ49 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ubxn8Q9QZ49 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ubxn8Q9QZ49 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ubxn8Q9QZ49 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms