Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnnt3Q9QZ47 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnnt3Q9QZ47 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnnt3Q9QZ47 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnnt3Q9QZ47 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnnt3Q9QZ47 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnnt3Q9QZ47 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tnnt3Q9QZ47 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tnnt3Q9QZ47 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tnnt3Q9QZ47 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tnnt3Q9QZ47 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tnnt3Q9QZ47 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tnnt3Q9QZ47 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tnnt3Q9QZ47 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tnnt3Q9QZ47 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tnnt3Q9QZ47 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tnnt3Q9QZ47 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tnnt3Q9QZ47 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tnnt3Q9QZ47 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tnnt3Q9QZ47 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tnnt3Q9QZ47 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tnnt3Q9QZ47 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tnnt3Q9QZ47 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tnnt3Q9QZ47 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tnnt3Q9QZ47 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tnnt3Q9QZ47 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tnnt3Q9QZ47 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tnnt3Q9QZ47 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tnnt3Q9QZ47 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tnnt3Q9QZ47 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tnnt3Q9QZ47 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tnnt3Q9QZ47 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tnnt3Q9QZ47 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Tnnt3Q9QZ47 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tnnt3Q9QZ47 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tnnt3Q9QZ47 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnnt3Q9QZ47 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnnt3Q9QZ47 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnnt3Q9QZ47 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnnt3Q9QZ47 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnnt3Q9QZ47 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnnt3Q9QZ47 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnnt3Q9QZ47 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnnt3Q9QZ47 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnnt3Q9QZ47 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnnt3Q9QZ47 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnnt3Q9QZ47 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnnt3Q9QZ47 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnnt3Q9QZ47 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnnt3Q9QZ47 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnnt3Q9QZ47 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnnt3Q9QZ47 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnnt3Q9QZ47 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnnt3Q9QZ47 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnnt3Q9QZ47 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnnt3Q9QZ47 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnnt3Q9QZ47 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnnt3Q9QZ47 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnnt3Q9QZ47 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnnt3Q9QZ47 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnnt3Q9QZ47 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnnt3Q9QZ47 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnnt3Q9QZ47 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnnt3Q9QZ47 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnnt3Q9QZ47 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnnt3Q9QZ47 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnnt3Q9QZ47 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnnt3Q9QZ47 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnnt3Q9QZ47 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnnt3Q9QZ47 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnnt3Q9QZ47 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnnt3Q9QZ47 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnnt3Q9QZ47 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnnt3Q9QZ47 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnnt3Q9QZ47 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnnt3Q9QZ47 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnnt3Q9QZ47 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnnt3Q9QZ47 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnnt3Q9QZ47 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnnt3Q9QZ47 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnnt3Q9QZ47 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnnt3Q9QZ47 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnnt3Q9QZ47 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnnt3Q9QZ47 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnnt3Q9QZ47 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnnt3Q9QZ47 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnnt3Q9QZ47 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnnt3Q9QZ47 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnnt3Q9QZ47 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnnt3Q9QZ47 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnnt3Q9QZ47 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnnt3Q9QZ47 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnnt3Q9QZ47 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnnt3Q9QZ47 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnnt3Q9QZ47 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnnt3Q9QZ47 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnnt3Q9QZ47 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnnt3Q9QZ47 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnnt3Q9QZ47 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnnt3Q9QZ47 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms