Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF9

Ndrg3, Protein NDRG3, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndrg3Q9QYF9 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndrg3Q9QYF9 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndrg3Q9QYF9 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndrg3Q9QYF9 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndrg3Q9QYF9 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndrg3Q9QYF9 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndrg3Q9QYF9 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndrg3Q9QYF9 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndrg3Q9QYF9 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndrg3Q9QYF9 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndrg3Q9QYF9 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndrg3Q9QYF9 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndrg3Q9QYF9 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndrg3Q9QYF9 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndrg3Q9QYF9 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndrg3Q9QYF9 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndrg3Q9QYF9 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndrg3Q9QYF9 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndrg3Q9QYF9 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndrg3Q9QYF9 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndrg3Q9QYF9 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndrg3Q9QYF9 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndrg3Q9QYF9 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndrg3Q9QYF9 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndrg3Q9QYF9 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndrg3Q9QYF9 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndrg3Q9QYF9 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndrg3Q9QYF9 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndrg3Q9QYF9 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndrg3Q9QYF9 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ndrg3Q9QYF9 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ndrg3Q9QYF9 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ndrg3Q9QYF9 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ndrg3Q9QYF9 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ndrg3Q9QYF9 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ndrg3Q9QYF9 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ndrg3Q9QYF9 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndrg3Q9QYF9 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndrg3Q9QYF9 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndrg3Q9QYF9 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndrg3Q9QYF9 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndrg3Q9QYF9 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndrg3Q9QYF9 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndrg3Q9QYF9 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndrg3Q9QYF9 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndrg3Q9QYF9 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndrg3Q9QYF9 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndrg3Q9QYF9 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndrg3Q9QYF9 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndrg3Q9QYF9 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndrg3Q9QYF9 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndrg3Q9QYF9 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndrg3Q9QYF9 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndrg3Q9QYF9 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndrg3Q9QYF9 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndrg3Q9QYF9 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndrg3Q9QYF9 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndrg3Q9QYF9 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndrg3Q9QYF9 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndrg3Q9QYF9 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndrg3Q9QYF9 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndrg3Q9QYF9 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndrg3Q9QYF9 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndrg3Q9QYF9 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndrg3Q9QYF9 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndrg3Q9QYF9 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndrg3Q9QYF9 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndrg3Q9QYF9 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndrg3Q9QYF9 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndrg3Q9QYF9 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndrg3Q9QYF9 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndrg3Q9QYF9 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndrg3Q9QYF9 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndrg3Q9QYF9 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndrg3Q9QYF9 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndrg3Q9QYF9 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndrg3Q9QYF9 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndrg3Q9QYF9 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndrg3Q9QYF9 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndrg3Q9QYF9 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndrg3Q9QYF9 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndrg3Q9QYF9 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndrg3Q9QYF9 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndrg3Q9QYF9 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndrg3Q9QYF9 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndrg3Q9QYF9 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndrg3Q9QYF9 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndrg3Q9QYF9 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndrg3Q9QYF9 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndrg3Q9QYF9 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndrg3Q9QYF9 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndrg3Q9QYF9 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndrg3Q9QYF9 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndrg3Q9QYF9 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndrg3Q9QYF9 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndrg3Q9QYF9 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndrg3Q9QYF9 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndrg3Q9QYF9 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndrg3Q9QYF9 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndrg3Q9QYF9 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms