Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY23

Pkp3, Plakophilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp3Q9QY23 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pkp3Q9QY23 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pkp3Q9QY23 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pkp3Q9QY23 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pkp3Q9QY23 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pkp3Q9QY23 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pkp3Q9QY23 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pkp3Q9QY23 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pkp3Q9QY23 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Pkp3Q9QY23 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pkp3Q9QY23 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pkp3Q9QY23 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pkp3Q9QY23 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pkp3Q9QY23 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pkp3Q9QY23 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pkp3Q9QY23 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pkp3Q9QY23 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pkp3Q9QY23 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pkp3Q9QY23 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pkp3Q9QY23 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pkp3Q9QY23 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Pkp3Q9QY23 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pkp3Q9QY23 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Pkp3Q9QY23 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pkp3Q9QY23 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pkp3Q9QY23 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pkp3Q9QY23 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pkp3Q9QY23 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pkp3Q9QY23 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pkp3Q9QY23 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pkp3Q9QY23 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pkp3Q9QY23 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pkp3Q9QY23 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pkp3Q9QY23 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pkp3Q9QY23 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pkp3Q9QY23 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pkp3Q9QY23 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pkp3Q9QY23 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pkp3Q9QY23 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pkp3Q9QY23 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pkp3Q9QY23 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Pkp3Q9QY23 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pkp3Q9QY23 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pkp3Q9QY23 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pkp3Q9QY23 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pkp3Q9QY23 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pkp3Q9QY23 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pkp3Q9QY23 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pkp3Q9QY23 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pkp3Q9QY23 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pkp3Q9QY23 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pkp3Q9QY23 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pkp3Q9QY23 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pkp3Q9QY23 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pkp3Q9QY23 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pkp3Q9QY23 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Pkp3Q9QY23 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Pkp3Q9QY23 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pkp3Q9QY23 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Pkp3Q9QY23 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pkp3Q9QY23 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pkp3Q9QY23 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pkp3Q9QY23 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pkp3Q9QY23 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pkp3Q9QY23 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pkp3Q9QY23 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pkp3Q9QY23 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pkp3Q9QY23 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pkp3Q9QY23 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pkp3Q9QY23 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pkp3Q9QY23 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pkp3Q9QY23 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pkp3Q9QY23 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pkp3Q9QY23 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pkp3Q9QY23 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pkp3Q9QY23 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pkp3Q9QY23 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pkp3Q9QY23 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pkp3Q9QY23 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pkp3Q9QY23 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Pkp3Q9QY23 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pkp3Q9QY23 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pkp3Q9QY23 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pkp3Q9QY23 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pkp3Q9QY23 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pkp3Q9QY23 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pkp3Q9QY23 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pkp3Q9QY23 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pkp3Q9QY23 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pkp3Q9QY23 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pkp3Q9QY23 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pkp3Q9QY23 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Pkp3Q9QY23 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pkp3Q9QY23 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Pkp3Q9QY23 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Pkp3Q9QY23 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pkp3Q9QY23 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pkp3Q9QY23 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Pkp3Q9QY23 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Pkp3Q9QY23 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms