Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV1

Cbx8, Chromobox protein homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx8Q9QXV1 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cbx8Q9QXV1 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cbx8Q9QXV1 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cbx8Q9QXV1 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cbx8Q9QXV1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cbx8Q9QXV1 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cbx8Q9QXV1 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cbx8Q9QXV1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cbx8Q9QXV1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cbx8Q9QXV1 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cbx8Q9QXV1 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cbx8Q9QXV1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cbx8Q9QXV1 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cbx8Q9QXV1 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cbx8Q9QXV1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cbx8Q9QXV1 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cbx8Q9QXV1 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cbx8Q9QXV1 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cbx8Q9QXV1 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cbx8Q9QXV1 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cbx8Q9QXV1 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cbx8Q9QXV1 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cbx8Q9QXV1 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cbx8Q9QXV1 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Cbx8Q9QXV1 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cbx8Q9QXV1 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cbx8Q9QXV1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cbx8Q9QXV1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cbx8Q9QXV1 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cbx8Q9QXV1 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cbx8Q9QXV1 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cbx8Q9QXV1 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cbx8Q9QXV1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cbx8Q9QXV1 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cbx8Q9QXV1 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cbx8Q9QXV1 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cbx8Q9QXV1 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cbx8Q9QXV1 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cbx8Q9QXV1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cbx8Q9QXV1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cbx8Q9QXV1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cbx8Q9QXV1 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cbx8Q9QXV1 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cbx8Q9QXV1 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cbx8Q9QXV1 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cbx8Q9QXV1 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cbx8Q9QXV1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cbx8Q9QXV1 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cbx8Q9QXV1 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cbx8Q9QXV1 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cbx8Q9QXV1 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cbx8Q9QXV1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cbx8Q9QXV1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cbx8Q9QXV1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cbx8Q9QXV1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cbx8Q9QXV1 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cbx8Q9QXV1 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cbx8Q9QXV1 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cbx8Q9QXV1 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cbx8Q9QXV1 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cbx8Q9QXV1 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cbx8Q9QXV1 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cbx8Q9QXV1 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cbx8Q9QXV1 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Cbx8Q9QXV1 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cbx8Q9QXV1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Cbx8Q9QXV1 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cbx8Q9QXV1 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cbx8Q9QXV1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cbx8Q9QXV1 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cbx8Q9QXV1 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cbx8Q9QXV1 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cbx8Q9QXV1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cbx8Q9QXV1 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cbx8Q9QXV1 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cbx8Q9QXV1 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cbx8Q9QXV1 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cbx8Q9QXV1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cbx8Q9QXV1 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cbx8Q9QXV1 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cbx8Q9QXV1 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Cbx8Q9QXV1 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Cbx8Q9QXV1 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Cbx8Q9QXV1 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cbx8Q9QXV1 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cbx8Q9QXV1 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cbx8Q9QXV1 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cbx8Q9QXV1 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cbx8Q9QXV1 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cbx8Q9QXV1 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cbx8Q9QXV1 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cbx8Q9QXV1 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cbx8Q9QXV1 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cbx8Q9QXV1 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cbx8Q9QXV1 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cbx8Q9QXV1 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cbx8Q9QXV1 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cbx8Q9QXV1 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cbx8Q9QXV1 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cbx8Q9QXV1 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms