Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV0

Pcsk1n, ProSAAS, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk1nQ9QXV0 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pcsk1nQ9QXV0 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pcsk1nQ9QXV0 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Pcsk1nQ9QXV0 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pcsk1nQ9QXV0 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pcsk1nQ9QXV0 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pcsk1nQ9QXV0 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pcsk1nQ9QXV0 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pcsk1nQ9QXV0 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pcsk1nQ9QXV0 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pcsk1nQ9QXV0 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pcsk1nQ9QXV0 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pcsk1nQ9QXV0 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pcsk1nQ9QXV0 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pcsk1nQ9QXV0 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pcsk1nQ9QXV0 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pcsk1nQ9QXV0 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pcsk1nQ9QXV0 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pcsk1nQ9QXV0 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Pcsk1nQ9QXV0 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pcsk1nQ9QXV0 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pcsk1nQ9QXV0 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pcsk1nQ9QXV0 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Pcsk1nQ9QXV0 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pcsk1nQ9QXV0 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pcsk1nQ9QXV0 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pcsk1nQ9QXV0 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pcsk1nQ9QXV0 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pcsk1nQ9QXV0 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pcsk1nQ9QXV0 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pcsk1nQ9QXV0 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pcsk1nQ9QXV0 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Pcsk1nQ9QXV0 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pcsk1nQ9QXV0 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pcsk1nQ9QXV0 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Pcsk1nQ9QXV0 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Pcsk1nQ9QXV0 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pcsk1nQ9QXV0 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pcsk1nQ9QXV0 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pcsk1nQ9QXV0 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pcsk1nQ9QXV0 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pcsk1nQ9QXV0 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pcsk1nQ9QXV0 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pcsk1nQ9QXV0 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pcsk1nQ9QXV0 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pcsk1nQ9QXV0 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pcsk1nQ9QXV0 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pcsk1nQ9QXV0 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pcsk1nQ9QXV0 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pcsk1nQ9QXV0 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pcsk1nQ9QXV0 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pcsk1nQ9QXV0 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pcsk1nQ9QXV0 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pcsk1nQ9QXV0 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pcsk1nQ9QXV0 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pcsk1nQ9QXV0 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pcsk1nQ9QXV0 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pcsk1nQ9QXV0 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pcsk1nQ9QXV0 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pcsk1nQ9QXV0 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pcsk1nQ9QXV0 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pcsk1nQ9QXV0 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pcsk1nQ9QXV0 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pcsk1nQ9QXV0 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pcsk1nQ9QXV0 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pcsk1nQ9QXV0 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pcsk1nQ9QXV0 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pcsk1nQ9QXV0 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pcsk1nQ9QXV0 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pcsk1nQ9QXV0 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pcsk1nQ9QXV0 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pcsk1nQ9QXV0 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Pcsk1nQ9QXV0 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pcsk1nQ9QXV0 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pcsk1nQ9QXV0 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pcsk1nQ9QXV0 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Pcsk1nQ9QXV0 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pcsk1nQ9QXV0 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pcsk1nQ9QXV0 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pcsk1nQ9QXV0 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pcsk1nQ9QXV0 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pcsk1nQ9QXV0 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pcsk1nQ9QXV0 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pcsk1nQ9QXV0 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pcsk1nQ9QXV0 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pcsk1nQ9QXV0 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pcsk1nQ9QXV0 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pcsk1nQ9QXV0 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pcsk1nQ9QXV0 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pcsk1nQ9QXV0 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pcsk1nQ9QXV0 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pcsk1nQ9QXV0 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pcsk1nQ9QXV0 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pcsk1nQ9QXV0 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pcsk1nQ9QXV0 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Pcsk1nQ9QXV0 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pcsk1nQ9QXV0 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pcsk1nQ9QXV0 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pcsk1nQ9QXV0 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pcsk1nQ9QXV0 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms