Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXN3

Trip4, Activating signal cointegrator 1, mousemouse

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip4Q9QXN3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trip4Q9QXN3 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trip4Q9QXN3 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trip4Q9QXN3 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Trip4Q9QXN3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trip4Q9QXN3 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trip4Q9QXN3 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trip4Q9QXN3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trip4Q9QXN3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trip4Q9QXN3 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trip4Q9QXN3 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trip4Q9QXN3 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trip4Q9QXN3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Trip4Q9QXN3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Trip4Q9QXN3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Trip4Q9QXN3 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Trip4Q9QXN3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Trip4Q9QXN3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trip4Q9QXN3 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trip4Q9QXN3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trip4Q9QXN3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Trip4Q9QXN3 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trip4Q9QXN3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trip4Q9QXN3 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trip4Q9QXN3 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trip4Q9QXN3 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trip4Q9QXN3 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Trip4Q9QXN3 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trip4Q9QXN3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trip4Q9QXN3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trip4Q9QXN3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trip4Q9QXN3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trip4Q9QXN3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trip4Q9QXN3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trip4Q9QXN3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trip4Q9QXN3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trip4Q9QXN3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trip4Q9QXN3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trip4Q9QXN3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trip4Q9QXN3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trip4Q9QXN3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trip4Q9QXN3 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trip4Q9QXN3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trip4Q9QXN3 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trip4Q9QXN3 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trip4Q9QXN3 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trip4Q9QXN3 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Trip4Q9QXN3 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Trip4Q9QXN3 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trip4Q9QXN3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trip4Q9QXN3 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trip4Q9QXN3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trip4Q9QXN3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trip4Q9QXN3 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trip4Q9QXN3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trip4Q9QXN3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trip4Q9QXN3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trip4Q9QXN3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trip4Q9QXN3 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trip4Q9QXN3 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trip4Q9QXN3 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trip4Q9QXN3 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trip4Q9QXN3 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Trip4Q9QXN3 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trip4Q9QXN3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trip4Q9QXN3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trip4Q9QXN3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trip4Q9QXN3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trip4Q9QXN3 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trip4Q9QXN3 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trip4Q9QXN3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trip4Q9QXN3 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trip4Q9QXN3 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trip4Q9QXN3 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trip4Q9QXN3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trip4Q9QXN3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trip4Q9QXN3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trip4Q9QXN3 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trip4Q9QXN3 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trip4Q9QXN3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trip4Q9QXN3 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Trip4Q9QXN3 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trip4Q9QXN3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trip4Q9QXN3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trip4Q9QXN3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trip4Q9QXN3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trip4Q9QXN3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trip4Q9QXN3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trip4Q9QXN3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trip4Q9QXN3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trip4Q9QXN3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trip4Q9QXN3 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trip4Q9QXN3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trip4Q9QXN3 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trip4Q9QXN3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trip4Q9QXN3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trip4Q9QXN3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trip4Q9QXN3 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trip4Q9QXN3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trip4Q9QXN3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms