Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trpc5Q9QX29 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trpc5Q9QX29 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trpc5Q9QX29 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Trpc5Q9QX29 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trpc5Q9QX29 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trpc5Q9QX29 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trpc5Q9QX29 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trpc5Q9QX29 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trpc5Q9QX29 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trpc5Q9QX29 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trpc5Q9QX29 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trpc5Q9QX29 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trpc5Q9QX29 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trpc5Q9QX29 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trpc5Q9QX29 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Trpc5Q9QX29 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trpc5Q9QX29 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trpc5Q9QX29 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Trpc5Q9QX29 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Trpc5Q9QX29 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trpc5Q9QX29 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trpc5Q9QX29 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trpc5Q9QX29 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trpc5Q9QX29 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Trpc5Q9QX29 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trpc5Q9QX29 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trpc5Q9QX29 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trpc5Q9QX29 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trpc5Q9QX29 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Trpc5Q9QX29 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trpc5Q9QX29 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trpc5Q9QX29 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trpc5Q9QX29 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Trpc5Q9QX29 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trpc5Q9QX29 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trpc5Q9QX29 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Trpc5Q9QX29 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trpc5Q9QX29 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Trpc5Q9QX29 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trpc5Q9QX29 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trpc5Q9QX29 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trpc5Q9QX29 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trpc5Q9QX29 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trpc5Q9QX29 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trpc5Q9QX29 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trpc5Q9QX29 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trpc5Q9QX29 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trpc5Q9QX29 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trpc5Q9QX29 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trpc5Q9QX29 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trpc5Q9QX29 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trpc5Q9QX29 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trpc5Q9QX29 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trpc5Q9QX29 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Trpc5Q9QX29 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trpc5Q9QX29 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trpc5Q9QX29 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trpc5Q9QX29 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trpc5Q9QX29 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trpc5Q9QX29 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trpc5Q9QX29 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trpc5Q9QX29 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trpc5Q9QX29 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Trpc5Q9QX29 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trpc5Q9QX29 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Trpc5Q9QX29 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trpc5Q9QX29 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trpc5Q9QX29 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trpc5Q9QX29 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trpc5Q9QX29 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trpc5Q9QX29 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trpc5Q9QX29 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trpc5Q9QX29 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trpc5Q9QX29 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trpc5Q9QX29 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trpc5Q9QX29 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trpc5Q9QX29 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trpc5Q9QX29 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trpc5Q9QX29 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trpc5Q9QX29 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trpc5Q9QX29 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Trpc5Q9QX29 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trpc5Q9QX29 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trpc5Q9QX29 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trpc5Q9QX29 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trpc5Q9QX29 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trpc5Q9QX29 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trpc5Q9QX29 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trpc5Q9QX29 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trpc5Q9QX29 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trpc5Q9QX29 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trpc5Q9QX29 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trpc5Q9QX29 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trpc5Q9QX29 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trpc5Q9QX29 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trpc5Q9QX29 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trpc5Q9QX29 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trpc5Q9QX29 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trpc5Q9QX29 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms