Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN9

Dkk3, Dickkopf-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk3Q9QUN9 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dkk3Q9QUN9 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dkk3Q9QUN9 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dkk3Q9QUN9 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dkk3Q9QUN9 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dkk3Q9QUN9 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dkk3Q9QUN9 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Dkk3Q9QUN9 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dkk3Q9QUN9 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Dkk3Q9QUN9 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dkk3Q9QUN9 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dkk3Q9QUN9 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Dkk3Q9QUN9 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Dkk3Q9QUN9 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dkk3Q9QUN9 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dkk3Q9QUN9 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dkk3Q9QUN9 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dkk3Q9QUN9 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Dkk3Q9QUN9 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dkk3Q9QUN9 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dkk3Q9QUN9 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dkk3Q9QUN9 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Dkk3Q9QUN9 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dkk3Q9QUN9 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Dkk3Q9QUN9 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Dkk3Q9QUN9 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dkk3Q9QUN9 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dkk3Q9QUN9 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dkk3Q9QUN9 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dkk3Q9QUN9 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dkk3Q9QUN9 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dkk3Q9QUN9 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dkk3Q9QUN9 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dkk3Q9QUN9 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Dkk3Q9QUN9 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dkk3Q9QUN9 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dkk3Q9QUN9 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dkk3Q9QUN9 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dkk3Q9QUN9 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dkk3Q9QUN9 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dkk3Q9QUN9 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dkk3Q9QUN9 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dkk3Q9QUN9 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Dkk3Q9QUN9 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dkk3Q9QUN9 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dkk3Q9QUN9 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dkk3Q9QUN9 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Dkk3Q9QUN9 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dkk3Q9QUN9 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dkk3Q9QUN9 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dkk3Q9QUN9 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dkk3Q9QUN9 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dkk3Q9QUN9 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Dkk3Q9QUN9 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Dkk3Q9QUN9 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dkk3Q9QUN9 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dkk3Q9QUN9 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dkk3Q9QUN9 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dkk3Q9QUN9 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dkk3Q9QUN9 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dkk3Q9QUN9 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dkk3Q9QUN9 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dkk3Q9QUN9 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dkk3Q9QUN9 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dkk3Q9QUN9 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dkk3Q9QUN9 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dkk3Q9QUN9 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dkk3Q9QUN9 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dkk3Q9QUN9 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dkk3Q9QUN9 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dkk3Q9QUN9 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dkk3Q9QUN9 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Dkk3Q9QUN9 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dkk3Q9QUN9 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Dkk3Q9QUN9 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dkk3Q9QUN9 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dkk3Q9QUN9 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dkk3Q9QUN9 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dkk3Q9QUN9 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dkk3Q9QUN9 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dkk3Q9QUN9 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dkk3Q9QUN9 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dkk3Q9QUN9 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dkk3Q9QUN9 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dkk3Q9QUN9 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dkk3Q9QUN9 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dkk3Q9QUN9 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dkk3Q9QUN9 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dkk3Q9QUN9 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dkk3Q9QUN9 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dkk3Q9QUN9 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dkk3Q9QUN9 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dkk3Q9QUN9 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dkk3Q9QUN9 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dkk3Q9QUN9 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dkk3Q9QUN9 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dkk3Q9QUN9 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dkk3Q9QUN9 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dkk3Q9QUN9 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dkk3Q9QUN9 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms