Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUG2

Polk, DNA polymerase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolkQ9QUG2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PolkQ9QUG2 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PolkQ9QUG2 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PolkQ9QUG2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PolkQ9QUG2 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PolkQ9QUG2 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PolkQ9QUG2 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PolkQ9QUG2 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PolkQ9QUG2 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PolkQ9QUG2 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PolkQ9QUG2 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PolkQ9QUG2 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PolkQ9QUG2 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PolkQ9QUG2 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PolkQ9QUG2 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PolkQ9QUG2 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PolkQ9QUG2 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PolkQ9QUG2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PolkQ9QUG2 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PolkQ9QUG2 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PolkQ9QUG2 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PolkQ9QUG2 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PolkQ9QUG2 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PolkQ9QUG2 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PolkQ9QUG2 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PolkQ9QUG2 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PolkQ9QUG2 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PolkQ9QUG2 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PolkQ9QUG2 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PolkQ9QUG2 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PolkQ9QUG2 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PolkQ9QUG2 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PolkQ9QUG2 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PolkQ9QUG2 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PolkQ9QUG2 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PolkQ9QUG2 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PolkQ9QUG2 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PolkQ9QUG2 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PolkQ9QUG2 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PolkQ9QUG2 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PolkQ9QUG2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PolkQ9QUG2 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PolkQ9QUG2 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PolkQ9QUG2 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PolkQ9QUG2 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PolkQ9QUG2 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PolkQ9QUG2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PolkQ9QUG2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PolkQ9QUG2 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PolkQ9QUG2 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PolkQ9QUG2 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PolkQ9QUG2 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PolkQ9QUG2 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PolkQ9QUG2 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PolkQ9QUG2 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PolkQ9QUG2 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PolkQ9QUG2 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PolkQ9QUG2 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PolkQ9QUG2 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PolkQ9QUG2 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PolkQ9QUG2 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PolkQ9QUG2 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PolkQ9QUG2 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PolkQ9QUG2 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PolkQ9QUG2 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PolkQ9QUG2 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PolkQ9QUG2 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PolkQ9QUG2 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PolkQ9QUG2 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PolkQ9QUG2 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PolkQ9QUG2 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PolkQ9QUG2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PolkQ9QUG2 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PolkQ9QUG2 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PolkQ9QUG2 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PolkQ9QUG2 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PolkQ9QUG2 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PolkQ9QUG2 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PolkQ9QUG2 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PolkQ9QUG2 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PolkQ9QUG2 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PolkQ9QUG2 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PolkQ9QUG2 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PolkQ9QUG2 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PolkQ9QUG2 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PolkQ9QUG2 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PolkQ9QUG2 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PolkQ9QUG2 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PolkQ9QUG2 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PolkQ9QUG2 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PolkQ9QUG2 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PolkQ9QUG2 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PolkQ9QUG2 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PolkQ9QUG2 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PolkQ9QUG2 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PolkQ9QUG2 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PolkQ9QUG2 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PolkQ9QUG2 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PolkQ9QUG2 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PolkQ9QUG2 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.5 ms