Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM62

Reep6, Receptor expression-enhancing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep6Q9JM62 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms