Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV2

Trpc4ap, Short transient receptor potential channel 4-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc4apQ9JLV2 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trpc4apQ9JLV2 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trpc4apQ9JLV2 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trpc4apQ9JLV2 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trpc4apQ9JLV2 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trpc4apQ9JLV2 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trpc4apQ9JLV2 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trpc4apQ9JLV2 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trpc4apQ9JLV2 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trpc4apQ9JLV2 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trpc4apQ9JLV2 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trpc4apQ9JLV2 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trpc4apQ9JLV2 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trpc4apQ9JLV2 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trpc4apQ9JLV2 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trpc4apQ9JLV2 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trpc4apQ9JLV2 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trpc4apQ9JLV2 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trpc4apQ9JLV2 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trpc4apQ9JLV2 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trpc4apQ9JLV2 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trpc4apQ9JLV2 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trpc4apQ9JLV2 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trpc4apQ9JLV2 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trpc4apQ9JLV2 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trpc4apQ9JLV2 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Trpc4apQ9JLV2 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Trpc4apQ9JLV2 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trpc4apQ9JLV2 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trpc4apQ9JLV2 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trpc4apQ9JLV2 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trpc4apQ9JLV2 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trpc4apQ9JLV2 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trpc4apQ9JLV2 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trpc4apQ9JLV2 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trpc4apQ9JLV2 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trpc4apQ9JLV2 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trpc4apQ9JLV2 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trpc4apQ9JLV2 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trpc4apQ9JLV2 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trpc4apQ9JLV2 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trpc4apQ9JLV2 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trpc4apQ9JLV2 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trpc4apQ9JLV2 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trpc4apQ9JLV2 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trpc4apQ9JLV2 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Trpc4apQ9JLV2 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trpc4apQ9JLV2 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trpc4apQ9JLV2 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trpc4apQ9JLV2 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trpc4apQ9JLV2 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trpc4apQ9JLV2 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trpc4apQ9JLV2 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trpc4apQ9JLV2 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trpc4apQ9JLV2 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trpc4apQ9JLV2 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trpc4apQ9JLV2 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trpc4apQ9JLV2 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trpc4apQ9JLV2 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trpc4apQ9JLV2 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trpc4apQ9JLV2 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trpc4apQ9JLV2 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trpc4apQ9JLV2 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trpc4apQ9JLV2 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trpc4apQ9JLV2 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trpc4apQ9JLV2 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trpc4apQ9JLV2 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trpc4apQ9JLV2 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trpc4apQ9JLV2 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trpc4apQ9JLV2 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trpc4apQ9JLV2 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trpc4apQ9JLV2 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trpc4apQ9JLV2 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trpc4apQ9JLV2 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trpc4apQ9JLV2 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trpc4apQ9JLV2 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trpc4apQ9JLV2 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trpc4apQ9JLV2 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trpc4apQ9JLV2 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trpc4apQ9JLV2 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trpc4apQ9JLV2 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trpc4apQ9JLV2 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trpc4apQ9JLV2 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trpc4apQ9JLV2 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trpc4apQ9JLV2 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trpc4apQ9JLV2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trpc4apQ9JLV2 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trpc4apQ9JLV2 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trpc4apQ9JLV2 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trpc4apQ9JLV2 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trpc4apQ9JLV2 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trpc4apQ9JLV2 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trpc4apQ9JLV2 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trpc4apQ9JLV2 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trpc4apQ9JLV2 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trpc4apQ9JLV2 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trpc4apQ9JLV2 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trpc4apQ9JLV2 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trpc4apQ9JLV2 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trpc4apQ9JLV2 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms