Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ldb3Q9JKS4 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ldb3Q9JKS4 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ldb3Q9JKS4 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ldb3Q9JKS4 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ldb3Q9JKS4 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ldb3Q9JKS4 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ldb3Q9JKS4 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ldb3Q9JKS4 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ldb3Q9JKS4 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ldb3Q9JKS4 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ldb3Q9JKS4 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ldb3Q9JKS4 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ldb3Q9JKS4 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ldb3Q9JKS4 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ldb3Q9JKS4 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ldb3Q9JKS4 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ldb3Q9JKS4 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ldb3Q9JKS4 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ldb3Q9JKS4 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ldb3Q9JKS4 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ldb3Q9JKS4 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ldb3Q9JKS4 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ldb3Q9JKS4 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ldb3Q9JKS4 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ldb3Q9JKS4 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ldb3Q9JKS4 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ldb3Q9JKS4 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ldb3Q9JKS4 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ldb3Q9JKS4 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ldb3Q9JKS4 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ldb3Q9JKS4 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ldb3Q9JKS4 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ldb3Q9JKS4 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ldb3Q9JKS4 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ldb3Q9JKS4 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ldb3Q9JKS4 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ldb3Q9JKS4 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ldb3Q9JKS4 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ldb3Q9JKS4 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ldb3Q9JKS4 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ldb3Q9JKS4 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ldb3Q9JKS4 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ldb3Q9JKS4 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ldb3Q9JKS4 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ldb3Q9JKS4 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ldb3Q9JKS4 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ldb3Q9JKS4 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ldb3Q9JKS4 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ldb3Q9JKS4 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ldb3Q9JKS4 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ldb3Q9JKS4 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ldb3Q9JKS4 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ldb3Q9JKS4 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ldb3Q9JKS4 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ldb3Q9JKS4 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ldb3Q9JKS4 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ldb3Q9JKS4 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ldb3Q9JKS4 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ldb3Q9JKS4 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ldb3Q9JKS4 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ldb3Q9JKS4 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ldb3Q9JKS4 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ldb3Q9JKS4 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ldb3Q9JKS4 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ldb3Q9JKS4 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ldb3Q9JKS4 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ldb3Q9JKS4 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ldb3Q9JKS4 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ldb3Q9JKS4 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ldb3Q9JKS4 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ldb3Q9JKS4 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ldb3Q9JKS4 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ldb3Q9JKS4 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ldb3Q9JKS4 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ldb3Q9JKS4 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ldb3Q9JKS4 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ldb3Q9JKS4 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ldb3Q9JKS4 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ldb3Q9JKS4 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ldb3Q9JKS4 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ldb3Q9JKS4 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ldb3Q9JKS4 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ldb3Q9JKS4 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ldb3Q9JKS4 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ldb3Q9JKS4 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ldb3Q9JKS4 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ldb3Q9JKS4 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ldb3Q9JKS4 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ldb3Q9JKS4 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ldb3Q9JKS4 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ldb3Q9JKS4 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ldb3Q9JKS4 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ldb3Q9JKS4 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ldb3Q9JKS4 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ldb3Q9JKS4 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ldb3Q9JKS4 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ldb3Q9JKS4 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ldb3Q9JKS4 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ldb3Q9JKS4 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms