Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKJ9

Cyp39a1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp39a1Q9JKJ9 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cyp39a1Q9JKJ9 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Cyp39a1Q9JKJ9 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Cyp39a1Q9JKJ9 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cyp39a1Q9JKJ9 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cyp39a1Q9JKJ9 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cyp39a1Q9JKJ9 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cyp39a1Q9JKJ9 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cyp39a1Q9JKJ9 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cyp39a1Q9JKJ9 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cyp39a1Q9JKJ9 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cyp39a1Q9JKJ9 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cyp39a1Q9JKJ9 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cyp39a1Q9JKJ9 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Cyp39a1Q9JKJ9 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cyp39a1Q9JKJ9 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cyp39a1Q9JKJ9 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Cyp39a1Q9JKJ9 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cyp39a1Q9JKJ9 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cyp39a1Q9JKJ9 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cyp39a1Q9JKJ9 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cyp39a1Q9JKJ9 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cyp39a1Q9JKJ9 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cyp39a1Q9JKJ9 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cyp39a1Q9JKJ9 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cyp39a1Q9JKJ9 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cyp39a1Q9JKJ9 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cyp39a1Q9JKJ9 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cyp39a1Q9JKJ9 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cyp39a1Q9JKJ9 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cyp39a1Q9JKJ9 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cyp39a1Q9JKJ9 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cyp39a1Q9JKJ9 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cyp39a1Q9JKJ9 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cyp39a1Q9JKJ9 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cyp39a1Q9JKJ9 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cyp39a1Q9JKJ9 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cyp39a1Q9JKJ9 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cyp39a1Q9JKJ9 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cyp39a1Q9JKJ9 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cyp39a1Q9JKJ9 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cyp39a1Q9JKJ9 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cyp39a1Q9JKJ9 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cyp39a1Q9JKJ9 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cyp39a1Q9JKJ9 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cyp39a1Q9JKJ9 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cyp39a1Q9JKJ9 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Cyp39a1Q9JKJ9 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cyp39a1Q9JKJ9 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Cyp39a1Q9JKJ9 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cyp39a1Q9JKJ9 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cyp39a1Q9JKJ9 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cyp39a1Q9JKJ9 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cyp39a1Q9JKJ9 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cyp39a1Q9JKJ9 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cyp39a1Q9JKJ9 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cyp39a1Q9JKJ9 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cyp39a1Q9JKJ9 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cyp39a1Q9JKJ9 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cyp39a1Q9JKJ9 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cyp39a1Q9JKJ9 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cyp39a1Q9JKJ9 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cyp39a1Q9JKJ9 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cyp39a1Q9JKJ9 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cyp39a1Q9JKJ9 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cyp39a1Q9JKJ9 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cyp39a1Q9JKJ9 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cyp39a1Q9JKJ9 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cyp39a1Q9JKJ9 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cyp39a1Q9JKJ9 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cyp39a1Q9JKJ9 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Cyp39a1Q9JKJ9 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cyp39a1Q9JKJ9 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cyp39a1Q9JKJ9 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cyp39a1Q9JKJ9 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cyp39a1Q9JKJ9 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cyp39a1Q9JKJ9 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cyp39a1Q9JKJ9 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms