Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trem1Q9JKE2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trem1Q9JKE2 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trem1Q9JKE2 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trem1Q9JKE2 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trem1Q9JKE2 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trem1Q9JKE2 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trem1Q9JKE2 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trem1Q9JKE2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trem1Q9JKE2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trem1Q9JKE2 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trem1Q9JKE2 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trem1Q9JKE2 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trem1Q9JKE2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trem1Q9JKE2 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trem1Q9JKE2 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trem1Q9JKE2 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trem1Q9JKE2 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trem1Q9JKE2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trem1Q9JKE2 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trem1Q9JKE2 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trem1Q9JKE2 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trem1Q9JKE2 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trem1Q9JKE2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trem1Q9JKE2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trem1Q9JKE2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trem1Q9JKE2 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trem1Q9JKE2 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trem1Q9JKE2 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trem1Q9JKE2 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trem1Q9JKE2 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trem1Q9JKE2 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trem1Q9JKE2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trem1Q9JKE2 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trem1Q9JKE2 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trem1Q9JKE2 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trem1Q9JKE2 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trem1Q9JKE2 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trem1Q9JKE2 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trem1Q9JKE2 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trem1Q9JKE2 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trem1Q9JKE2 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trem1Q9JKE2 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trem1Q9JKE2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trem1Q9JKE2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trem1Q9JKE2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trem1Q9JKE2 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trem1Q9JKE2 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trem1Q9JKE2 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trem1Q9JKE2 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trem1Q9JKE2 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trem1Q9JKE2 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trem1Q9JKE2 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trem1Q9JKE2 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trem1Q9JKE2 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trem1Q9JKE2 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trem1Q9JKE2 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trem1Q9JKE2 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trem1Q9JKE2 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trem1Q9JKE2 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trem1Q9JKE2 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trem1Q9JKE2 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trem1Q9JKE2 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trem1Q9JKE2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trem1Q9JKE2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trem1Q9JKE2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trem1Q9JKE2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trem1Q9JKE2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trem1Q9JKE2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trem1Q9JKE2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trem1Q9JKE2 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trem1Q9JKE2 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trem1Q9JKE2 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trem1Q9JKE2 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trem1Q9JKE2 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trem1Q9JKE2 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trem1Q9JKE2 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trem1Q9JKE2 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trem1Q9JKE2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trem1Q9JKE2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trem1Q9JKE2 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trem1Q9JKE2 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trem1Q9JKE2 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trem1Q9JKE2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trem1Q9JKE2 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trem1Q9JKE2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trem1Q9JKE2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trem1Q9JKE2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trem1Q9JKE2 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trem1Q9JKE2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trem1Q9JKE2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trem1Q9JKE2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trem1Q9JKE2 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trem1Q9JKE2 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trem1Q9JKE2 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trem1Q9JKE2 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trem1Q9JKE2 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trem1Q9JKE2 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trem1Q9JKE2 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trem1Q9JKE2 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms