Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ybx3Q9JKB3 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ybx3Q9JKB3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ybx3Q9JKB3 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ybx3Q9JKB3 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ybx3Q9JKB3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ybx3Q9JKB3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ybx3Q9JKB3 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ybx3Q9JKB3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ybx3Q9JKB3 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ybx3Q9JKB3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ybx3Q9JKB3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ybx3Q9JKB3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ybx3Q9JKB3 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ybx3Q9JKB3 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ybx3Q9JKB3 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ybx3Q9JKB3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ybx3Q9JKB3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ybx3Q9JKB3 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ybx3Q9JKB3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ybx3Q9JKB3 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ybx3Q9JKB3 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ybx3Q9JKB3 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ybx3Q9JKB3 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ybx3Q9JKB3 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ybx3Q9JKB3 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ybx3Q9JKB3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ybx3Q9JKB3 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ybx3Q9JKB3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ybx3Q9JKB3 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ybx3Q9JKB3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ybx3Q9JKB3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ybx3Q9JKB3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ybx3Q9JKB3 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ybx3Q9JKB3 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ybx3Q9JKB3 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ybx3Q9JKB3 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ybx3Q9JKB3 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ybx3Q9JKB3 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ybx3Q9JKB3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ybx3Q9JKB3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ybx3Q9JKB3 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ybx3Q9JKB3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ybx3Q9JKB3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ybx3Q9JKB3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ybx3Q9JKB3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ybx3Q9JKB3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ybx3Q9JKB3 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ybx3Q9JKB3 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ybx3Q9JKB3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ybx3Q9JKB3 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ybx3Q9JKB3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ybx3Q9JKB3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ybx3Q9JKB3 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ybx3Q9JKB3 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ybx3Q9JKB3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ybx3Q9JKB3 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ybx3Q9JKB3 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ybx3Q9JKB3 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ybx3Q9JKB3 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ybx3Q9JKB3 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ybx3Q9JKB3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ybx3Q9JKB3 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ybx3Q9JKB3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ybx3Q9JKB3 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ybx3Q9JKB3 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ybx3Q9JKB3 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ybx3Q9JKB3 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ybx3Q9JKB3 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ybx3Q9JKB3 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ybx3Q9JKB3 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ybx3Q9JKB3 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ybx3Q9JKB3 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ybx3Q9JKB3 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ybx3Q9JKB3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ybx3Q9JKB3 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ybx3Q9JKB3 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ybx3Q9JKB3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ybx3Q9JKB3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ybx3Q9JKB3 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ybx3Q9JKB3 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ybx3Q9JKB3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ybx3Q9JKB3 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ybx3Q9JKB3 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ybx3Q9JKB3 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ybx3Q9JKB3 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ybx3Q9JKB3 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ybx3Q9JKB3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ybx3Q9JKB3 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ybx3Q9JKB3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ybx3Q9JKB3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ybx3Q9JKB3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ybx3Q9JKB3 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ybx3Q9JKB3 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ybx3Q9JKB3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ybx3Q9JKB3 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ybx3Q9JKB3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ybx3Q9JKB3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ybx3Q9JKB3 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ybx3Q9JKB3 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms