Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB1

Uchl3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl3Q9JKB1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Uchl3Q9JKB1 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Uchl3Q9JKB1 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Uchl3Q9JKB1 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Uchl3Q9JKB1 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Uchl3Q9JKB1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Uchl3Q9JKB1 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Uchl3Q9JKB1 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Uchl3Q9JKB1 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Uchl3Q9JKB1 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Uchl3Q9JKB1 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Uchl3Q9JKB1 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Uchl3Q9JKB1 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Uchl3Q9JKB1 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Uchl3Q9JKB1 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Uchl3Q9JKB1 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Uchl3Q9JKB1 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Uchl3Q9JKB1 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Uchl3Q9JKB1 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Uchl3Q9JKB1 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Uchl3Q9JKB1 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Uchl3Q9JKB1 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Uchl3Q9JKB1 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Uchl3Q9JKB1 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Uchl3Q9JKB1 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Uchl3Q9JKB1 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Uchl3Q9JKB1 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Uchl3Q9JKB1 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Uchl3Q9JKB1 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Uchl3Q9JKB1 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Uchl3Q9JKB1 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Uchl3Q9JKB1 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
Uchl3Q9JKB1 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Uchl3Q9JKB1 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Uchl3Q9JKB1 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Uchl3Q9JKB1 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Uchl3Q9JKB1 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Uchl3Q9JKB1 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Uchl3Q9JKB1 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Uchl3Q9JKB1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Uchl3Q9JKB1 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Uchl3Q9JKB1 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Uchl3Q9JKB1 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Uchl3Q9JKB1 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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Uchl3Q9JKB1 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Uchl3Q9JKB1 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Uchl3Q9JKB1 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Uchl3Q9JKB1 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Uchl3Q9JKB1 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
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Uchl3Q9JKB1 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Uchl3Q9JKB1 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Uchl3Q9JKB1 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Uchl3Q9JKB1 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Uchl3Q9JKB1 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Uchl3Q9JKB1 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Uchl3Q9JKB1 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Uchl3Q9JKB1 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Uchl3Q9JKB1 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Uchl3Q9JKB1 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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Uchl3Q9JKB1 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Uchl3Q9JKB1 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Uchl3Q9JKB1 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Uchl3Q9JKB1 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Uchl3Q9JKB1 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Uchl3Q9JKB1 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Uchl3Q9JKB1 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Uchl3Q9JKB1 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Uchl3Q9JKB1 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Uchl3Q9JKB1 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Uchl3Q9JKB1 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Uchl3Q9JKB1 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Uchl3Q9JKB1 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Uchl3Q9JKB1 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Uchl3Q9JKB1 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Uchl3Q9JKB1 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Uchl3Q9JKB1 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Uchl3Q9JKB1 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Uchl3Q9JKB1 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Uchl3Q9JKB1 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Uchl3Q9JKB1 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Uchl3Q9JKB1 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Uchl3Q9JKB1 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Uchl3Q9JKB1 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Uchl3Q9JKB1 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Uchl3Q9JKB1 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Uchl3Q9JKB1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
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