Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY3

Smpd3, Sphingomyelin phosphodiesterase 3, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd3Q9JJY3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smpd3Q9JJY3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smpd3Q9JJY3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smpd3Q9JJY3 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smpd3Q9JJY3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smpd3Q9JJY3 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smpd3Q9JJY3 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smpd3Q9JJY3 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smpd3Q9JJY3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smpd3Q9JJY3 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smpd3Q9JJY3 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smpd3Q9JJY3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smpd3Q9JJY3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smpd3Q9JJY3 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smpd3Q9JJY3 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smpd3Q9JJY3 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Smpd3Q9JJY3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Smpd3Q9JJY3 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Smpd3Q9JJY3 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Smpd3Q9JJY3 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smpd3Q9JJY3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smpd3Q9JJY3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smpd3Q9JJY3 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smpd3Q9JJY3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smpd3Q9JJY3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smpd3Q9JJY3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smpd3Q9JJY3 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smpd3Q9JJY3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smpd3Q9JJY3 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smpd3Q9JJY3 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Smpd3Q9JJY3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smpd3Q9JJY3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smpd3Q9JJY3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smpd3Q9JJY3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smpd3Q9JJY3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smpd3Q9JJY3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smpd3Q9JJY3 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smpd3Q9JJY3 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smpd3Q9JJY3 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smpd3Q9JJY3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smpd3Q9JJY3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smpd3Q9JJY3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smpd3Q9JJY3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smpd3Q9JJY3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smpd3Q9JJY3 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Smpd3Q9JJY3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smpd3Q9JJY3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smpd3Q9JJY3 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smpd3Q9JJY3 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Smpd3Q9JJY3 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smpd3Q9JJY3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smpd3Q9JJY3 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smpd3Q9JJY3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smpd3Q9JJY3 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smpd3Q9JJY3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smpd3Q9JJY3 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smpd3Q9JJY3 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smpd3Q9JJY3 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smpd3Q9JJY3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smpd3Q9JJY3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Smpd3Q9JJY3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smpd3Q9JJY3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Smpd3Q9JJY3 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Smpd3Q9JJY3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smpd3Q9JJY3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smpd3Q9JJY3 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smpd3Q9JJY3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smpd3Q9JJY3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smpd3Q9JJY3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smpd3Q9JJY3 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smpd3Q9JJY3 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smpd3Q9JJY3 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Smpd3Q9JJY3 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smpd3Q9JJY3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smpd3Q9JJY3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smpd3Q9JJY3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smpd3Q9JJY3 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smpd3Q9JJY3 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smpd3Q9JJY3 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smpd3Q9JJY3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smpd3Q9JJY3 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smpd3Q9JJY3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smpd3Q9JJY3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Smpd3Q9JJY3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smpd3Q9JJY3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smpd3Q9JJY3 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smpd3Q9JJY3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smpd3Q9JJY3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smpd3Q9JJY3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smpd3Q9JJY3 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smpd3Q9JJY3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smpd3Q9JJY3 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smpd3Q9JJY3 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smpd3Q9JJY3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smpd3Q9JJY3 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smpd3Q9JJY3 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smpd3Q9JJY3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smpd3Q9JJY3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Smpd3Q9JJY3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Smpd3Q9JJY3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms