Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS0

Scube2, Signal peptide, CUB and EGF-like domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scube2Q9JJS0 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scube2Q9JJS0 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scube2Q9JJS0 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scube2Q9JJS0 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scube2Q9JJS0 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scube2Q9JJS0 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scube2Q9JJS0 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scube2Q9JJS0 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scube2Q9JJS0 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scube2Q9JJS0 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scube2Q9JJS0 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scube2Q9JJS0 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scube2Q9JJS0 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scube2Q9JJS0 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scube2Q9JJS0 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scube2Q9JJS0 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scube2Q9JJS0 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scube2Q9JJS0 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Scube2Q9JJS0 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Scube2Q9JJS0 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Scube2Q9JJS0 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Scube2Q9JJS0 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scube2Q9JJS0 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scube2Q9JJS0 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scube2Q9JJS0 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scube2Q9JJS0 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scube2Q9JJS0 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scube2Q9JJS0 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scube2Q9JJS0 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scube2Q9JJS0 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scube2Q9JJS0 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scube2Q9JJS0 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scube2Q9JJS0 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scube2Q9JJS0 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scube2Q9JJS0 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scube2Q9JJS0 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scube2Q9JJS0 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scube2Q9JJS0 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scube2Q9JJS0 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scube2Q9JJS0 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scube2Q9JJS0 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scube2Q9JJS0 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scube2Q9JJS0 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scube2Q9JJS0 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scube2Q9JJS0 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scube2Q9JJS0 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scube2Q9JJS0 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Scube2Q9JJS0 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scube2Q9JJS0 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scube2Q9JJS0 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scube2Q9JJS0 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scube2Q9JJS0 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scube2Q9JJS0 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scube2Q9JJS0 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scube2Q9JJS0 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scube2Q9JJS0 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scube2Q9JJS0 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scube2Q9JJS0 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scube2Q9JJS0 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scube2Q9JJS0 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scube2Q9JJS0 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scube2Q9JJS0 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scube2Q9JJS0 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scube2Q9JJS0 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scube2Q9JJS0 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scube2Q9JJS0 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scube2Q9JJS0 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scube2Q9JJS0 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scube2Q9JJS0 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scube2Q9JJS0 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scube2Q9JJS0 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scube2Q9JJS0 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scube2Q9JJS0 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scube2Q9JJS0 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scube2Q9JJS0 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scube2Q9JJS0 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scube2Q9JJS0 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scube2Q9JJS0 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scube2Q9JJS0 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Scube2Q9JJS0 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scube2Q9JJS0 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scube2Q9JJS0 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scube2Q9JJS0 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Scube2Q9JJS0 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scube2Q9JJS0 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scube2Q9JJS0 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scube2Q9JJS0 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scube2Q9JJS0 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scube2Q9JJS0 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scube2Q9JJS0 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Scube2Q9JJS0 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Scube2Q9JJS0 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Scube2Q9JJS0 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Scube2Q9JJS0 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Scube2Q9JJS0 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Scube2Q9JJS0 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Scube2Q9JJS0 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scube2Q9JJS0 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scube2Q9JJS0 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scube2Q9JJS0 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms