Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJR9

Nrip3, Nuclear receptor-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip3Q9JJR9 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nrip3Q9JJR9 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nrip3Q9JJR9 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nrip3Q9JJR9 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nrip3Q9JJR9 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nrip3Q9JJR9 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nrip3Q9JJR9 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nrip3Q9JJR9 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nrip3Q9JJR9 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nrip3Q9JJR9 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nrip3Q9JJR9 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nrip3Q9JJR9 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nrip3Q9JJR9 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nrip3Q9JJR9 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nrip3Q9JJR9 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nrip3Q9JJR9 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nrip3Q9JJR9 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nrip3Q9JJR9 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nrip3Q9JJR9 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nrip3Q9JJR9 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nrip3Q9JJR9 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nrip3Q9JJR9 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nrip3Q9JJR9 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nrip3Q9JJR9 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nrip3Q9JJR9 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nrip3Q9JJR9 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nrip3Q9JJR9 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nrip3Q9JJR9 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nrip3Q9JJR9 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nrip3Q9JJR9 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nrip3Q9JJR9 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nrip3Q9JJR9 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nrip3Q9JJR9 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nrip3Q9JJR9 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nrip3Q9JJR9 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nrip3Q9JJR9 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nrip3Q9JJR9 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nrip3Q9JJR9 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nrip3Q9JJR9 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nrip3Q9JJR9 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nrip3Q9JJR9 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nrip3Q9JJR9 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nrip3Q9JJR9 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nrip3Q9JJR9 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nrip3Q9JJR9 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nrip3Q9JJR9 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nrip3Q9JJR9 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nrip3Q9JJR9 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nrip3Q9JJR9 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nrip3Q9JJR9 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nrip3Q9JJR9 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nrip3Q9JJR9 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nrip3Q9JJR9 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nrip3Q9JJR9 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nrip3Q9JJR9 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nrip3Q9JJR9 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nrip3Q9JJR9 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nrip3Q9JJR9 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nrip3Q9JJR9 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nrip3Q9JJR9 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nrip3Q9JJR9 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nrip3Q9JJR9 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nrip3Q9JJR9 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nrip3Q9JJR9 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nrip3Q9JJR9 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nrip3Q9JJR9 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nrip3Q9JJR9 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nrip3Q9JJR9 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nrip3Q9JJR9 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nrip3Q9JJR9 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nrip3Q9JJR9 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nrip3Q9JJR9 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nrip3Q9JJR9 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nrip3Q9JJR9 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nrip3Q9JJR9 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nrip3Q9JJR9 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nrip3Q9JJR9 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nrip3Q9JJR9 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nrip3Q9JJR9 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nrip3Q9JJR9 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nrip3Q9JJR9 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nrip3Q9JJR9 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nrip3Q9JJR9 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nrip3Q9JJR9 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nrip3Q9JJR9 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nrip3Q9JJR9 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nrip3Q9JJR9 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nrip3Q9JJR9 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nrip3Q9JJR9 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nrip3Q9JJR9 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nrip3Q9JJR9 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nrip3Q9JJR9 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nrip3Q9JJR9 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nrip3Q9JJR9 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nrip3Q9JJR9 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nrip3Q9JJR9 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nrip3Q9JJR9 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nrip3Q9JJR9 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nrip3Q9JJR9 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nrip3Q9JJR9 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms