Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJQ0

Pigb, GPI mannosyltransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PigbQ9JJQ0 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PigbQ9JJQ0 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PigbQ9JJQ0 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PigbQ9JJQ0 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PigbQ9JJQ0 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PigbQ9JJQ0 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PigbQ9JJQ0 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PigbQ9JJQ0 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PigbQ9JJQ0 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PigbQ9JJQ0 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PigbQ9JJQ0 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PigbQ9JJQ0 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PigbQ9JJQ0 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PigbQ9JJQ0 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PigbQ9JJQ0 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PigbQ9JJQ0 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PigbQ9JJQ0 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PigbQ9JJQ0 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PigbQ9JJQ0 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PigbQ9JJQ0 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PigbQ9JJQ0 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PigbQ9JJQ0 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PigbQ9JJQ0 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PigbQ9JJQ0 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PigbQ9JJQ0 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PigbQ9JJQ0 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PigbQ9JJQ0 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PigbQ9JJQ0 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PigbQ9JJQ0 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PigbQ9JJQ0 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PigbQ9JJQ0 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PigbQ9JJQ0 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PigbQ9JJQ0 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PigbQ9JJQ0 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PigbQ9JJQ0 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PigbQ9JJQ0 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PigbQ9JJQ0 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PigbQ9JJQ0 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PigbQ9JJQ0 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PigbQ9JJQ0 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PigbQ9JJQ0 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PigbQ9JJQ0 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PigbQ9JJQ0 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PigbQ9JJQ0 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PigbQ9JJQ0 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PigbQ9JJQ0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PigbQ9JJQ0 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PigbQ9JJQ0 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PigbQ9JJQ0 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PigbQ9JJQ0 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PigbQ9JJQ0 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PigbQ9JJQ0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PigbQ9JJQ0 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PigbQ9JJQ0 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PigbQ9JJQ0 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PigbQ9JJQ0 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PigbQ9JJQ0 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PigbQ9JJQ0 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PigbQ9JJQ0 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PigbQ9JJQ0 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PigbQ9JJQ0 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PigbQ9JJQ0 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PigbQ9JJQ0 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PigbQ9JJQ0 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PigbQ9JJQ0 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PigbQ9JJQ0 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PigbQ9JJQ0 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PigbQ9JJQ0 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PigbQ9JJQ0 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PigbQ9JJQ0 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PigbQ9JJQ0 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PigbQ9JJQ0 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PigbQ9JJQ0 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PigbQ9JJQ0 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PigbQ9JJQ0 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PigbQ9JJQ0 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PigbQ9JJQ0 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PigbQ9JJQ0 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PigbQ9JJQ0 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PigbQ9JJQ0 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PigbQ9JJQ0 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PigbQ9JJQ0 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PigbQ9JJQ0 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PigbQ9JJQ0 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PigbQ9JJQ0 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PigbQ9JJQ0 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PigbQ9JJQ0 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PigbQ9JJQ0 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PigbQ9JJQ0 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PigbQ9JJQ0 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PigbQ9JJQ0 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PigbQ9JJQ0 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PigbQ9JJQ0 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PigbQ9JJQ0 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PigbQ9JJQ0 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PigbQ9JJQ0 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PigbQ9JJQ0 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PigbQ9JJQ0 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PigbQ9JJQ0 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PigbQ9JJQ0 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms