Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN2

Zfhx4, Zinc finger homeobox protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 3,550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfhx4Q9JJN2 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfhx4Q9JJN2 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfhx4Q9JJN2 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfhx4Q9JJN2 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfhx4Q9JJN2 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfhx4Q9JJN2 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfhx4Q9JJN2 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfhx4Q9JJN2 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfhx4Q9JJN2 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfhx4Q9JJN2 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfhx4Q9JJN2 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfhx4Q9JJN2 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfhx4Q9JJN2 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfhx4Q9JJN2 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfhx4Q9JJN2 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfhx4Q9JJN2 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfhx4Q9JJN2 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfhx4Q9JJN2 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfhx4Q9JJN2 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfhx4Q9JJN2 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfhx4Q9JJN2 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfhx4Q9JJN2 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfhx4Q9JJN2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfhx4Q9JJN2 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfhx4Q9JJN2 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfhx4Q9JJN2 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfhx4Q9JJN2 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfhx4Q9JJN2 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfhx4Q9JJN2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfhx4Q9JJN2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfhx4Q9JJN2 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfhx4Q9JJN2 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfhx4Q9JJN2 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfhx4Q9JJN2 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfhx4Q9JJN2 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfhx4Q9JJN2 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfhx4Q9JJN2 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfhx4Q9JJN2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfhx4Q9JJN2 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfhx4Q9JJN2 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfhx4Q9JJN2 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfhx4Q9JJN2 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfhx4Q9JJN2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfhx4Q9JJN2 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfhx4Q9JJN2 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfhx4Q9JJN2 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfhx4Q9JJN2 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfhx4Q9JJN2 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfhx4Q9JJN2 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfhx4Q9JJN2 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfhx4Q9JJN2 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfhx4Q9JJN2 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfhx4Q9JJN2 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfhx4Q9JJN2 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfhx4Q9JJN2 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfhx4Q9JJN2 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfhx4Q9JJN2 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfhx4Q9JJN2 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfhx4Q9JJN2 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfhx4Q9JJN2 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfhx4Q9JJN2 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfhx4Q9JJN2 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfhx4Q9JJN2 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfhx4Q9JJN2 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfhx4Q9JJN2 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfhx4Q9JJN2 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfhx4Q9JJN2 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfhx4Q9JJN2 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfhx4Q9JJN2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfhx4Q9JJN2 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfhx4Q9JJN2 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfhx4Q9JJN2 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfhx4Q9JJN2 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfhx4Q9JJN2 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfhx4Q9JJN2 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfhx4Q9JJN2 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfhx4Q9JJN2 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfhx4Q9JJN2 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfhx4Q9JJN2 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfhx4Q9JJN2 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfhx4Q9JJN2 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfhx4Q9JJN2 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfhx4Q9JJN2 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfhx4Q9JJN2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfhx4Q9JJN2 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfhx4Q9JJN2 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zfhx4Q9JJN2 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zfhx4Q9JJN2 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zfhx4Q9JJN2 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zfhx4Q9JJN2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zfhx4Q9JJN2 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zfhx4Q9JJN2 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfhx4Q9JJN2 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfhx4Q9JJN2 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfhx4Q9JJN2 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfhx4Q9JJN2 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfhx4Q9JJN2 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfhx4Q9JJN2 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfhx4Q9JJN2 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfhx4Q9JJN2 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms